干扰波发射出去后，神秘飞行物的攻击果然出现了混乱。它们的行动变得不再协调一致，有的甚至出现了互相碰撞的情况。抓住这个机会，队员们加大火力攻击力度，成功消灭了一部分神秘飞行物。
然而，剩余的神秘飞行物似乎察觉到了飞船的意图，改变了攻击策略。它们不再集中火力攻击，而是分散开来，从不同角度对飞船发动攻击。这样一来，飞船的防御出现了多处漏洞，护盾能量急剧下降。
在关键时刻，一名队员冒着生命危险爬出飞船，抢修出现故障的武器系统。他在恶劣的太空环境中灵活穿梭，一次次躲过敌人的攻击。经过艰难的努力，武器系统终于恢复正常，并发挥出更强大的威力，成功击退了剩余的神秘飞行物。
经过这场激烈的战斗，飞船多处受损，队员们也身心俱疲。但他们没有放弃，迅速投入到飞船的修复工作中。在修复过程中，工程师们根据艾利克斯科研团队对晶体能量的研究成果，对飞船的能源系统和防御系统进行了升级改造，期望在未来面对危机时能够具备更强的应对能力。
与此同时，基地方面发来消息，要求他们加快返航速度，因为宇宙危机正以超乎想象的速度恶化。各方观测数据表明，各种异常的宇宙现象在不同星系频繁出现，许多星球的生态系统正在遭受严重破坏。“我们必须赶在一切无法挽回之前将样本带回基地，找到解决危机的办法！”队长坚定地告诉队员们。
飞船经过紧急修复后继续加速返航。在航行途中，艾利克斯和科研团队争分夺秒地对样本进行更加深入的研究，并与基地的科研专家们进行远程协作。他们将采集到的各种数据、分析结果以及遇到的问题实时传输到基地，共同探讨解决方案。
一天夜晚，艾利克斯独自坐在科研舱内，望着舱外深邃的宇宙。繁星闪烁，看似宁静却又隐藏着无数的危机。他深知这次使命的重大，自己肩负着全宇宙的希望。经过无数次模拟实验和数据分析，他终于在晶体能量与宇宙危机之间发现了一组可能的关联方程式。“如果这个方程式成立，那么我们就能够通过控制晶体能量，来稳定宇宙中的能量失衡。”艾利克斯喃喃自语道，兴奋之情溢于言表。
他立刻组织科研团队对这个方程式进行进一步论证和验证工作。经过数小时的紧张运算与实验，他们几乎可以确定这个方程式是正确的，这为解决宇宙危机打开了新的大门。
这个消息迅速传遍了飞船，队员们都备受鼓舞。他们仿佛看到了胜利的曙光，疲惫的身躯再次充满了力量。“虽然还需要回到基地进行更多的实验和验证，但这无疑是我们此行最重大的收获。”队长说道，脸上露出久违的笑容。
随着距离基地越来越近，队员们的心也越来越激动。然而，他们并没有放松警惕。在接近基地的最后一段航程中，基地传来警告信息，附近区域出现了一股神秘的能量波动异常现象，建议他们谨慎航行。
这股神秘能量波动不同于他们之前遇到的任何情况，性质极为诡异。波动范围不断扩大，周围的空间和时间都出现了轻微的扭曲。“这股能量波动充满了未知的危险，我们必须小心应对，但也不能因此而停滞不前。”队长说道。
飞船小心翼翼地靠近，艾利克斯带领科研团队全力探测分析这股神秘能量。他们发现这股能量似乎是由某种古老的宇宙力量复苏引发的，并且与他们在“禁忌之地”遇到的神秘力量有着极其微妙的联系。
“或许这就是宇宙危机爆发的深层次源头之一。”艾利克斯推测道。为了更好地应对这股神秘能量，队员们紧急研究制定出一套全新的应对方案。
当飞船逐渐深入神秘能量波动区域时，时间与空间的扭曲效应愈发明显。仪器开始出现各种异常读数。