清晨，美琪、美雪和莉莉像往常一样走在上学路上，却发现天空有些异样。往日挂在东方的绚丽彩虹不见了踪影，取而代之的是灰蒙蒙的云层，仿佛给天空蒙上了一层厚重的纱。路边的花草也失去了生机，耷拉着脑袋，连平日里欢快鸣叫的小鸟都不见踪迹。
“彩虹怎么不见了？”美雪停下脚步，忧心忡忡地望着天空。美琪挠挠头，“不会又有什么魔法危机吧？”莉莉握紧书包带，黑魔盒在包里微微发烫，一种不安的预感涌上心头。
到了学校，同学们也都在议论纷纷。“听说邻镇的彩虹也消失了！”“而且自来水都变成黑色的了，好可怕！”听着这些议论，三人心头一紧。美琪压低声音说：“我们得找小蓝姐姐问问！”说着，她悄悄摸出能量盒，躲到操场角落发出求救信号。
没过多久，小蓝急匆匆地出现了。她脸色凝重，眉头紧锁：“魔仙堡的占星魔仙发现，魔法世界与人类世界的能量平衡被打破了。彩虹是连接两个世界的能量纽带，它的消失意味着有强大的黑暗力量在作祟。”
正当她们商量对策时，教室里突然传来尖叫声。三人冲进教室，只见原本洁白的墙壁上爬满了黑色藤蔓，所到之处，桌椅、书本瞬间被腐蚀成灰烬。美琪举起魔仙棒：“巴拉拉能量——沙罗沙罗——小魔仙全身变！”美雪和莉莉也迅速变身，三道光茫照亮了昏暗的教室。
“这些藤蔓有古怪，它们在吸收恐惧和负面情绪！”小蓝挥舞魔仙棒，金色光芒却只能暂时击退藤蔓。美琪灵机一动，大喊：“同学们别怕！只要保持乐观，它们就无法变强！”她带头唱起欢快的歌，美雪和莉莉也跟着附和。神奇的是，随着歌声响起，藤蔓的生长速度明显减慢。
与此同时，魔仙堡内也陷入危机。占星塔的星盘疯狂旋转，不断迸出火花。魔仙女王面色苍白，看着水晶球里蔓延的黑暗：“必须找到黑暗力量的源头！游乐，你和小蓝立刻去调查。美琪、美雪、莉莉，你们留在人类世界守护重要的能量节点。”
游乐和小蓝循着魔法波动，追踪到了废弃的游乐园。旋转木马的马匹蒙着厚厚的灰尘，摩天轮的轿厢在风中摇晃。突然，一阵阴冷的笑声传来，一个黑影从过山车轨道上浮现——竟然是失踪已久的阿杰！他的双眼闪烁着诡异的紫光，身上缠绕着黑色雾气。
“阿杰，你怎么会变成这样？”小蓝惊讶地问。阿杰发出一阵狂笑：“拜你们所赐！上次被你们教训后，我找到了更强大的力量！现在，我要让整个世界都陷入黑暗！”原来，他在被美琪等人教训后，偶然间接触到了一股神秘的黑暗力量，从此被其操控。
游乐二话不说，拔出魔法剑冲了上去：“少废话，看招！”银色剑光与黑色雾气激烈碰撞，游乐园里的设施在魔法余波中纷纷倒塌。小蓝则施展治愈魔法，试图净化阿杰身上的黑暗，但每次接近，都会被一股强大的排斥力弹开。
在学校这边，美琪、美雪和莉莉守护着教学楼的能量节点。然而，黑暗藤蔓越来越多，它们突破了三人的防线，朝着学校的钟楼蔓延——那里是人类世界重要的能量枢纽之一。“不能让它们破坏钟楼！”莉莉集中精神，将黑魔法中控制能量的技巧运用到极致，编织出一道黑色屏障暂时阻挡藤蔓。
美雪则翻开百宝书，寻找破解之法。“找到了！需要用七种颜色的纯净魔法能量，重新凝聚彩虹之力！”美雪喊道。美琪立刻回应：“可我们上哪找七种颜色的魔法能量？”
关键时刻，严莉莉想到了办法：“我在黑魔法典籍里看到过，每种情绪都对应着不同颜色的魔法能量。我们可以发动同学们，一起汇聚积极的情绪！”于是，三人带着同学们来到操场，手拉手围成一个大圈。美琪大声说：“大家想想开心的事，把快乐传递出来！”
随着大家的努力，金色的希望之光、红色的热情之火、蓝色的平静之水等七种颜色的光芒从人群中升起，汇聚成一道绚丽的彩虹光束，射向天空。在彩虹的照耀下，黑暗藤蔓发出刺耳的尖叫，纷纷化为灰烬。
另一边，游乐和小蓝在与阿杰的战斗中陷入僵局。阿杰吸收了太多黑暗力量，变得异常强大。危急时刻，美琪、美雪和莉莉赶到，将彩虹之力注入小蓝和游乐的魔法武器中。“巴拉拉能量——彩虹风暴！”众人齐声大喊，一道七彩光芒席卷而去，彻底净化了阿杰身上的黑暗力量。
阿杰瘫倒在地，恢复了意识，看着周围的一切，满脸懊悔：“我...我都做了些什么？”小蓝走上前，轻轻说：“只要愿意悔改，就还有机会。”
彩虹重新出现在天空，光芒洒在每个人身上。魔仙堡的危机解除了，学校也恢复了往日的生机。经过这次事件，美琪、美雪和莉莉更加明白了守护的意义，而阿杰也在大家的帮助下，开始学习光明魔法，努力弥补自己的过错。