这五大神是特别天神，五尊特别天神诞生后，又诞生了国之常立神、丰云野神等十二大神中，分部主管世间诸物。与中土的传说不同，中土传说中的神大多是独身的，但扶桑这十二大神中有五对夫妇。
其后又诞生了创造扶桑国土、掌管下界万物生育的根本之神伊邪那岐命和伊邪那美命，命即是神的意思。
众天神就诏示伊邪那岐命和伊邪那美命去修创国土。二神站在天之浮桥上，将众神赐予的天沼矛探入海中并搅动海水，再将矛提起。这时从矛尖滴下来的海水凝聚成岛，这就是淤能基吕岛，意为自然凝结成的岛子。
岛子形成后，伊邪那岐命和伊邪那美命降到岛上，树起天之玉柱，建立起八寻殿。然后，伊邪那岐命向他的妹子说：“我们围着这根天之玉柱走，在相遇的地方结合，生产国土吧。”
伊邪那美命点头说：“好的。”“那你从右边，我从左边，绕着相遇。”伊邪那岐命补充道。于是他们便绕着柱子走。当相遇时，伊邪那美命说：“哎呀真是个好男子”伊邪那岐命赶紧接着说到：“哎呀真是个好女子”忽然，他对他的妹子说：“女人先说话了，不吉利啊。”
虽然他们在这次结合后有了孩子，却是个水蛭子，即骨骼发育不全的胎儿。于是他们把这个孩子放进芦苇船，让它顺水流去。后来又生了淡岛，也没有算在所生的孩子里面。
在生产了淡岛后，伊邪那岐命就跟伊邪那美命商议：“我们这次生的孩子不好，去请教一下天神到底是什么缘故吧。”于是他们便一同回到高天原去见天神。见到天神后，天神让他们占卜神意。天神看着占卜的结果，对他们说：“因为女人先说话了，不好，回去重新说吧。”
二神回来，象以前那样绕着天之玉柱走。这次相遇时，伊邪那岐命抢先说：“哎呀真是个好女子”伊邪那美命应答道：“哎呀真是个好男子”
这样说过之后，二神再次结合，生产了淡道之穗之狭别岛、伊豫之二名岛、隐伎之三子岛、筑紫岛、津岛、伊伎岛、佐度岛、大倭丰秋津岛。这便形成了扶桑。
生完国土后，伊邪那岐命与伊邪那美命又生诸神。伊邪那美命在生火神时被烧伤，于是卧床不起。不久便因此而病死。在伊邪那美命死去之前，二神共生岛屿十四不算水蛭子和淡岛，生神三十三。
妙公主心道：“神也会死么”她见鱼婆婆等人表情十分严肃，也不敢问。
鱼婆婆往下续说：伊邪那美命死后，伊邪那岐命非常悲伤，喃喃地说：“我亲爱的妻子呵竟因为一个儿子的缘故，就丧失了你吗”他匍匐在女神的枕边，又匍匐在女神的脚旁，悲痛地哭泣时，由泪水化成的神，名叫泣泽女神。死去的伊邪那美命则埋葬在比婆山上。
痛哭之后，伊邪那岐命拔出所佩之剑，走向他的儿子火之迦具土神。于是火神被杀死。他很想见到他的妻子伊邪那美命，便一直追到黄泉国。
在黄泉国大殿门前，伊邪那美命从殿内开门相迎。这时伊邪那岐命和妻子商量说：“我亲爱的妻子啊，我和你创造的国土还没有完成，请跟我回去吧”
伊邪那美命回答说：“可惜呀你没有早些来，我已经吃了黄泉的饭食。不过，既然是你特意来找我，我也愿意回去啊让我和黄泉的神商量商量。但是在这期间千万不要看我呀。”
这样说过之后，伊邪那美命就回到了殿里。时间过了很久，伊邪那岐命实在等待得不耐烦了，就取下左发髻上戴着的多齿木梳，折下一个边齿，点起火来，到殿里去看。只见伊邪那美命满身蛆虫蠕动，气结喉塞，全身化为大雷到伏雷共八个雷神。
伊邪那岐命看到这种景象大吃一惊，十分害怕，转身便逃。伊邪那美命羞愤交集，立即派黄泉鬼女在后面紧紧追赶。伊邪那岐命取下头上的黑发饰，扔到地上。黑发饰上很快长出野葡萄，伊邪那岐命就乘鬼女摘葡萄吃的时候逃脱了。伊邪那美命又派八雷神，率领一千五百名黄泉军追赶上来。伊邪那岐命拔出所佩十拳剑，一边将冲上来的黄泉军砍倒，一边逃跑。一直被追到黄泉的边界比良坂。这时，伊邪那岐命从坂下的桃树上摘下三个桃子，等黄泉军追到时，便将桃子打向他们。看到桃子砸来，黄泉军慌忙逃了回去。伊邪那岐命对桃子说：“象方才帮助我那样，将来苇原中国的众生遇到患难时，你也去救他们吧”于是赐给它们名号叫意富加牟豆美命，意为大仙桃神。
最后，伊邪那美命亲自追来。伊邪那岐命用千引石堵住黄泉比良坂。他们隔着千引石面对面地站着，发出夫妻决绝的誓言。伊邪那美命说：“我的夫君呵，你既然这样待我，我就在你国每天杀死千人。”伊邪那岐命说：“我的妻子呵，你如果那样做，我呢，就每天建立一千五百个产房。”这样每天必死千人，每天也必生一千五百人。因此，伊邪那美命就被称为黄泉津大神。
伍封与梦王姬想不到神也会有家变，对视一眼，伍封心道：“这黄泉津大神，看来与中土掌管死亡的神一样。”
从黄泉国回来后，伊邪那岐命说：“我曾经到非常丑恶而又极其污秽的地方去过，所以必须清净一下我的身体。”于是来到筑紫的阿坡岐原，在那里举行袯襫仪式。由他扔掉的随身衣物化为了从船户神到边津甲斐辨罗神等十二神。