就在这时，团藏的身体突然发生异变。他那只被斩断的右臂伤口处，混合着鲜血与白色的液体，竟然开始疯狂地生长出绿色的树枝。木遁细胞在失去写轮眼的压制，又没有查克拉约束的情况下，彻底失控暴走了！“啊——！”凄厉的惨叫声从团藏口中传出，他的身体被不断生长的树枝缠绕、吞噬，痛苦不堪。
纲手皱着眉头，沉声道：“大家不要靠近，木遁细胞已经失控，会吞噬一切生命体。”她曾经见过无数次这样的实验事故，对此再清楚不过。
宇智波曜眼神冰冷，看着在地上痛苦挣扎的团藏，没有丝毫怜悯。他缓步上前，手中草薙剑闪烁着寒光，毫不犹豫地挥剑斩下，将团藏还在不断生长树枝的肢体彻底斩断。失去了肢体的支撑，团藏的气息越发微弱，只能躺在地上苟延残喘。
猿飞日斩站在原地，看着眼前这大势已去的一幕，心中五味杂陈。他曾经是木叶的领袖，是忍界闻名的“忍术教授”，手握至高无上的权力，掌控着村子的未来。他以为自己能够压制宇智波的崛起，能够继续维持猿飞一族的荣耀，可转眼间，一切都化为泡影。日向分家倒戈，医疗部、情报部被接管，上忍们纷纷倒向宇智波与千手，连自己最信任的团藏都成了阶下囚，而自己，双臂被废，众叛亲离。
他眼中闪过深深的落寞，还有对失去权力的无尽无奈。为什么？明明一切都还好好的，明明他还有机会压制宇智波曜，怎么会一下子就大势已去？为什么没有任何人愿意帮他？这些问题如同魔咒般在他脑海中盘旋，让他心神俱裂。最终，他再也承受不住这巨大的打击，眼前一黑，忍不住晕厥过去，重重地倒在地上。
局势彻底稳定下来后，宇智波曜站在火影大楼的天台之上，目光扫过下方平静下来的木叶村，沉声道：“传令下去，木叶继续保持封锁与最高战备状态，任何人不得擅自出入。胆敢趁机煽动民心、扰乱秩序者，杀无赦！”他的声音透过查克拉放大，传遍了整个木叶，带着不容置疑的威严。
“是！”下方的忍者们齐声响应，声音洪亮。
纲手随后补充道：“立即派人监视猿飞、志村、水户门、转寝四大家族的所有成员，不准他们随意走动。同时，以木叶的名义，召回所有在外执行任务的四大家族忍者，不得有误！”她的语气严肃，眼神锐利，展现出了强大的执行力。
巡逻的忍者们分成两队，一队在街巷间严密巡逻，维持秩序；另一队则推着装满蔬菜、食物的推车，挨家挨户地进行补给。同时，他们将三代高层的罪证一一告知村民：“三代火影高层长期进行人体实验，残害同村忍者！”“九尾袭村是他们策划的阴谋，只为巩固自己的权力！”“团藏窃取宇智波的写轮眼，亵渎初代火影的木遁细胞！”
这些消息如同重磅炸弹，在村民之间引发了巨大的震动。愤怒、失望、庆幸的情绪交织在一起，村民们纷纷咒骂三代高层的背叛，同时对宇智波与千手联军稳定局势充满了感激。“幸好有曜大人和纲手大人，不然木叶就真的完了！”“宇智波和千手才是真正守护木叶的力量！”在巡逻忍者的安抚下，村民们的情绪逐渐平复，木叶村上空的乌云也渐渐散去，温暖的阳光透过云层，洒落在这片经历了剧变的土地上，秩序正在一点点恢复。
三日后，上忍会议在火影大楼顶层的露天阳台召开。之所以选择在这里，一是因为参与会议的上忍人数众多，露天阳台空间充足；二是为了公开透明，向所有人展示木叶新势力的决心与诚意。明媚的阳光洒在阳台上，却无法驱散空气中的凝重气息。一个个木叶上忍身着整齐的忍者制服，神情肃穆地站在阳台上，目光复杂地望着前方的主位。
“把东西拿上来。”宇智波曜的声音打破了沉默。几名忍者捧着一叠厚厚的卷宗和一些密封的容器走了上来，将东西整齐地摆放在众人面前。卷宗上记录着根部这些年犯下的滔天罪行：详细的人体实验数据、谋害同村忍者的名单、贪墨前线忍具并高价贩卖到黑市的账目……密封的容器里，则装着一些令人毛骨悚然的实验样本。
“大家自己看吧。”宇智波曜示意众人传阅这些罪证。
上忍们纷纷上前，翻阅着卷宗，查看着样本，脸色越来越凝重，愤怒的情绪再次被点燃。“竟然对油女一族的毒虫进行纳米级改造，用来暗杀同村忍者！”“鞍马一族的幻术天才，竟然被他们抓去做实验，最后惨死！”“还有这账目，战争期间，前线忍者连忍具都不够用，他们竟然还在中饱私囊！”一声声怒斥响起，所有人都被根部的残忍与黑暗所震惊。他们可以接受忍村存在黑暗，用来对付敌人和叛忍，但绝不能容忍这种黑暗降临在同村同胞身上。
千手纲手走上前，目光扫过在场的所有上忍，沉声道：“三代火影高层的腐败与背叛，已经证据确凿。如今木叶刚刚经历剧变，不能没有领袖。我提议，由宇智波曜暂代火影之位，主持村子的日常事务，我将担任火影顾问，协助他处理政务。”
纲手的提议一出，阳台上顿时陷入了短暂的沉默。随后，一名上忍率先开口：“我赞成！曜大人实力强大，心怀木叶，有能力带领我们走出困境！”“我也赞成！纲手大人经验丰富，由二位联手，木叶必定能够重现辉煌！”“附议！”“附议！”赞同的声音此起彼伏，绝大多数上忍都选择了支持。那些曾经忠于三代的上忍，此刻也明白大势已去，再加上根部的罪证确凿，他们也没有了反对的理由。
宇智波曜缓缓站起身，目光坚定地望着众人，沉声道：“既然大家信任我，我便不会辜负这份重托。从今日起，我将以暂代火影的身份，带领木叶走向新的未来！”他的声音不大，却带着一股令人信服的力量。
紧接着，宇智波曜开始下达任命，完成木叶权力体系的全面更替：“任命千手纲手为火影辅佐，除担任火影顾问外，继续兼任医疗部部长一职，负责提升木叶的医疗水平，救治伤员。”
纲手微微颔首，接受了任命。
“任命千手绳树为暗部部长，宇智波浩二为暗部副部长，即刻起重整暗部，清除根部余孽，负责村子的暗中守护工作。”千手绳树是纲手的弟弟，实力不俗，且忠于宇智波曜与纲手，由他执掌暗部，既能够保证暗部的忠诚，也能平衡千手一族的权力。
千手绳树上前一步，沉声应道：“遵命！”
“任命旋涡玖辛奈为结界部部长，负责加固木叶的结界防御，确保村子的安全。”旋涡玖辛奈作为九尾人柱力，查克拉庞大，对封印术与结界术有着深刻的理解，是结界部部长的不二人选。
“交给我吧！”玖辛奈眼神坚定，大声回应。
“任命宇智波美琴为警务部部长，负责维护村子的治安，处理日常事务，保障村民的安全。”宇智波美琴不仅实力强大，心思缜密，更有着出色的管理能力，由她执掌警务部，能够让宇智波一族更好地融入木叶的管理体系。
宇智波美琴微微躬身：“定不辜负火影大人的信任。”
“任命日向日差、油女志黑、宇智波铁火、千手木为情报部正副部长，四人分工合作，接管所有情报工作，收集国内外的情报，为木叶的决策提供支持。”这一任命既拉拢了日向分家、油女一族等势力，也保证了情报部的权力平衡，避免被单一势力掌控。
日向日差等人纷纷上前领命，脸上带着激动与郑重。
最后，宇智波曜的目光落在波风水门与大蛇丸身上：“任命波风水门、大蛇丸成立专项调查组，彻查根部这些年犯下的所有罪行，清点根部的资源与情报，将所有涉案人员一网打尽，给所有受害者一个交代！”
波风水门眼神严肃：“保证完成任务！”大蛇丸则舔了舔嘴唇，眼中闪过一丝兴奋与期待：“有意思的工作呢。”
一道道任命下达，木叶的六大核心部门全部换上了宇智波与千手一系的人手，以及支持新政权的势力代表。这场以“划分蛋糕”形式完成的权力更替，既保证了新政权的稳定，也团结了木叶的大部分力量，让木叶在经历剧变后，迅速形成了新的权力核心。