—— 基础研究探索基因组“暗物质”功能注释的系统慢性病——AlphaGeno赋能非编码区调控图谱绘制
新闻稿
照亮基因组“暗物质”：AlphaGeno突破非编码区功能注释，为系统慢性病机制研究开辟新路径
人类基因组中，约98%的非编码区曾被长期视作“垃圾DNA”，如同宇宙中无法直接观测的暗物质，隐匿着生命调控与疾病发生的核心密码。如今，一项以AlphaGeno为核心工具的基础研究取得里程碑式进展，依托其覆盖11类调控模态的独特优势，全面开展人类基因组非编码区功能注释，揭示增强子-启动子长程互作规律，构建人-鼠跨物种调控元件进化图谱，成功破解“垃圾DNA”的功能奥秘，为系统慢性病的发病机制解析、精准预警与靶向干预提供了全新理论支撑与技术路径。
长期以来，生命科学与医学研究多聚焦于仅占基因组2%的蛋白质编码区，而占据绝大部分的非编码区因功能未知、调控复杂，成为基因组研究的“无人区”。但越来越多证据表明，非编码区是基因表达的“总调控师”，通过增强子、启动子、绝缘子等调控元件，以长程互作、时空特异性表达等方式，精准控制基因何时、何地、以何种强度表达，其异常调控与糖尿病、心血管疾病、神经退行性疾病、自身免疫病等系统慢性病的发生发展密切相关。传统研究手段受限于调控模态覆盖不全、长程互作难以捕捉、细胞特异性解析不足等瓶颈，无法全面解读非编码区的功能逻辑，导致慢性病病因研究长期停留在“表象层面”，难以触及核心遗传调控机制。
本次研究依托的AlphaGeno平台，突破了传统技术的多重局限，实现了非编码区研究的三大核心突破：其一，全模态覆盖，整合11类基因调控模态，对98%非编码区进行无死角功能注释，告别“碎片化解读”；其二，长程互作解析，精准捕捉增强子与启动子的远距离调控关系，厘清非编码区调控基因表达的“通讯网络”；其三，跨物种进化图谱构建，对比人、鼠基因组调控元件的保守性与差异性，揭示调控机制的进化规律，为动物实验向临床转化提供科学依据。
更具突破性的是，研究结合单细胞测序技术，突破传统 bulk 测序的“细胞平均化”局限，精准解析组织特异性、细胞周期特异性的非编码区调控模式，绘制出动态、精细的基因调控网络数据库。这意味着，研究人员能清晰看到，在不同器官、不同细胞状态下，非编码区如何“因地制宜”调控基因表达，其异常如何一步步触发细胞功能紊乱，最终诱发慢性病。例如，在胰岛β细胞中，特定非编码区增强子的异常调控，会导致胰岛素分泌相关基因表达失衡，成为2型糖尿病发生的核心诱因；在神经细胞中，非编码区调控紊乱则会加速神经元衰老，与阿尔茨海默病、帕金森病等神经退行性疾病直接相关。
业内专家评价，该研究首次实现了基因组非编码区的全景式、动态化、跨物种功能注释，将基因组研究从“编码区时代”推向“全基因组调控时代”，是基础生命科学的重大突破。对于临床医学而言，这一成果让系统慢性病的研究不再局限于症状与蛋白层面，而是深入到遗传调控的根源，为慢性病的早期筛查、分子分型、靶向药物研发提供了全新靶点与思路。未来，基于AlphaGeno构建的非编码区调控图谱，有望开发出针对慢性病的“遗传调控预警模型”，实现高危人群的提前干预；同时，靶向非编码区调控元件的精准治疗，也将成为慢性病治疗的新方向，打破传统药物“治标难治本”的困境。
此次研究不仅填补了基因组“暗物质”功能研究的空白，更搭建起基础研究与临床转化的桥梁。随着非编码区功能密码的逐步破解，人类对生命调控规律的认知将实现质的飞跃，系统慢性病这一威胁全球人类健康的难题，也将迎来从“被动治疗”到“主动防控”的根本性转变。
常见问题（FAQ）
1. 什么是基因组“暗物质”？为什么它被称为“垃圾DNA”？
基因组“暗物质”指人类基因组中约98%的非编码区DNA，这类DNA不直接编码蛋白质，因此在过去技术有限的情况下，被误认为没有功能，称作“垃圾DNA”。事实上，非编码区是基因表达的核心调控区域，包含增强子、启动子、非编码RNA等关键元件，如同基因的“开关”“调节器”，控制着基因的时空表达，其功能异常是疾病发生的重要根源。
2. AlphaGeno的核心优势是什么？相比传统技术有哪些突破？
AlphaGeno的核心优势是覆盖11类基因调控模态，能对人类基因组98%非编码区进行全面功能注释。传统技术仅能解析单一或少数调控模态，无法捕捉非编码区的完整调控逻辑；而AlphaGeno可揭示增强子-启动子长程互作规律，构建人-鼠跨物种调控元件进化图谱，同时结合单细胞测序，实现组织、细胞周期特异性的动态调控解析，真正做到“全维度、高精度、动态化”解读非编码区功能。
3. 非编码区调控与系统慢性病有什么关系？
系统慢性病（如糖尿病、心血管病、自身免疫病）并非由单一基因突变导致，而是基因调控网络长期紊乱的结果。非编码区作为基因调控的核心，其异常会导致增强子-启动子互作失衡、组织特异性表达紊乱，使相关基因持续异常表达，引发细胞代谢、免疫、分化功能失常，长期积累后诱发慢性病。可以说，非编码区调控异常是慢性病发生的“核心遗传根源”。
4. 单细胞测序技术在研究中起到什么作用？
传统测序技术会“平均化”不同细胞的基因信号，无法区分细胞间的调控差异。单细胞测序能精准解析单个细胞的非编码区调控模式，明确不同组织、不同细胞周期中，非编码区如何特异性调控基因表达。这一技术让研究从“组织层面”深入到“细胞层面”，能精准找到慢性病发生的“靶细胞”与“核心调控元件”，让研究结果更贴近生理病理真实状态。
5. 跨物种（人-鼠）调控元件进化图谱有什么意义？
小鼠是医学研究常用的模式生物，但人与鼠的基因组存在差异。构建跨物种调控元件进化图谱，能明确人、鼠非编码区调控元件的保守性与差异性，避免动物实验结果无法向临床转化的问题。这一图谱为慢性病机制研究、药物临床前验证提供了科学依据，让基础研究成果更高效、更精准地服务于人类健康。
6. 这项研究对普通人有什么实际价值？
对普通人而言，这项研究的价值体现在三方面：一是疾病预警，未来可通过检测非编码区调控状态，提前发现慢性病高危风险，实现早预防；二是精准治疗，靶向非编码区的新型药物将更精准、副作用更小，提升慢性病治疗效果；三是健康认知，让人们明白慢性病并非单纯“生活方式病”，而是遗传调控与环境共同作用的结果，助力科学健康管理。
7. 研究目前处于什么阶段？何时能应用于临床？
目前研究处于基础研究与临床转化前期，已完成非编码区调控图谱绘制、核心调控机制解析与典型案例验证。接下来将开展大规模临床样本验证、靶向药物研发等工作。预计5-10年内，基于非编码区调控的慢性病筛查模型将逐步应用于临床，靶向治疗药物也将进入临床试验阶段。
8. 心理学、中医原理如何与这项基因组研究结合？
从心理学角度，长期心理压力、情绪失衡会通过表观遗传调控影响非编码区的修饰状态，改变基因调控模式，加速慢性病发生；而积极的心理状态、情绪调节，能反向优化非编码区调控，维持基因表达稳定。
从中医原理看，非编码区的整体调控网络与中医“整体观念”“阴阳平衡”高度契合：非编码区调控元件的协同互作，如同中医脏腑的相生相克；增强子-启动子的动态平衡，对应中医“阴阳调和”；非编码区异常导致的慢性病，与中医“气血失衡、经络不通”的病机一致。中医的整体调理、辨证施治，本质是通过调节机体整体状态，修复非编码区的调控紊乱，实现“治本”。
高阅软文：98%的“垃圾DNA”竟是慢性病元凶！AI+基因组破解生命暗码，中医、心理学早有答案
我们总在追问：为什么坚持健康生活，还是会被慢性病盯上？为什么同样的生活习惯，有人安然无恙，有人却早早患上糖尿病、高血压、自身免疫病？
答案，藏在我们从未重视的**基因组“暗物质”**里——那占据人类基因组98%、曾被嘲笑为“垃圾DNA”的非编码区。
直到今天，依托AlphaGeno这一突破性技术，科学家终于撕开了“垃圾DNA”的伪装：它不是生命的“废弃代码”，而是掌控基因表达的总指挥部，是系统慢性病发生的核心根源。更奇妙的是，现代基因组学的这一发现，竟与中医的整体观念、心理学的心身理论完美呼应，跨越千年的智慧与前沿科技，在生命密码的探索中殊途同归。
一、被误解百年的“暗物质”：98%的DNA，决定你是否易患慢性病
2003年，人类基因组计划完成，我们读懂了2%的蛋白质编码区，却对剩下98%的非编码区束手无策。学界一度将其定义为“垃圾DNA”，认为是进化留下的“无用碎片”。
但随着研究深入，越来越多的证据推翻了这一结论：
- 人类90%以上的疾病相关突变，都发生在非编码区；
- 糖尿病、心血管病、阿尔茨海默病等慢性病，无一不与非编码区调控异常直接相关；
- 非编码区中的增强子、启动子，如同基因的“远程遥控器”，跨越数万碱基对，精准控制基因的“开”与“关”。
打个比方：如果把基因组看作一座城市，2%的编码区是“工厂”（生产蛋白质），98%的非编码区就是交通网、调度中心、信号灯，决定工厂何时开工、生产多少、运往何处。一旦调度中心失灵，工厂就会无序生产，城市运转崩溃——对应到人体，就是细胞功能紊乱、慢性病悄然发生。
这就是为什么，单纯研究2%的编码区，永远无法解开慢性病的谜团；这就是为什么，传统治疗只能缓解症状，无法触及疾病根源。
二、AlphaGeno破局：AI照亮暗物质，破解非编码区调控密码
长期以来，非编码区因调控模态多、长程互作复杂、细胞特异性强，成为基因组研究的“禁区”。直到AlphaGeno的出现，这一僵局被彻底打破。