试招之后的第三日，天机阁江南总部，象征着最高权力的天机殿内，济济一堂。除了镇守各方的要员通过特殊手段远程参与外，所有在总部的核心成员尽数到场。
南宫宸端坐于主位，气息依旧平和内敛，但经过前日那轻描淡写接下萧峰全力一击的一幕，此刻无人再敢以寻常目光视之。他的存在本身，就如同一根定海神针，让整个大殿充满了一种沉静而磅礴的力量感。
诸位，南宫宸开口，声音清晰地传入每个人耳中，如今天下暗流汹涌，蒙古崛起于北，新旧武林势力迭出于四方。我天机阁势力虽已遍布南北，然欲行非常之事，必先有非常之规。今日召集大家，便是要最终确立我阁之架构与根本规章，以便如臂使指，应对未来变局。
他目光扫过全场，最终落在身旁的黄蓉身上。黄蓉会意，起身走到大殿中央悬挂的巨大组织结构图前，手持玉杖，开始阐述经过数月推演、并得到南宫宸最终认可的方案。
经阁主最终裁定，天机阁组织架构如下：黄蓉声音清越，条理分明。
最高领袖，为阁主，由南宫宸担任，总揽全局，定夺一切重大决策。
玉杖上移，指向阁主之下。
设副阁主一名，由我黄蓉担任，兼任首席智囊，协助阁主处理日常事务，负责战略规划与统筹协调。
接着，玉杖落在组织结构图的核心部分——四部一堂一派的框架上。
其下，分设四部：
武部！黄蓉声音提高，部长，由萧峰担任！
萧峰踏前一步，抱拳领命，声如洪钟：萧峰领命！必不负阁主与诸位信任！
副部长，由郭靖、梅超风担任，协助萧部长统领我阁所有明面及隐藏的战斗力量，包括各分阁护卫、快速反应部队、特殊行动组等。负责武力征伐、要地守卫、人员护卫等一切与战斗相关事宜。
谋部！黄蓉继续，部长，由我兼任。
副部长，暂由朱聪先生（若已收录）担任，未来可视情况增补。谋部下设三司：战略司，负责长远规划与大局分析；情报司，负责信息收集、整理与分析；机巧司，负责机关、阵法、器械研发与应用。谋部为我阁大脑，需算无遗策。
医部！部长，由程灵素担任！
程灵素起身，盈盈一礼，声音温和却坚定：灵素领命。
副部长，由薛慕华担任（函谷八友神医）。医部负责所有医药相关事务，包括救治伤患、研发丹药、鉴别毒物、培育药草，并建立完善的医疗体系，保障我阁成员健康。同时，亦负责部分生物机理研究。
商部！部长，由马春花担任！