顾言琛的秩序符文立刻标记出节点位置：“左上方、右下方、正中央，三个节点分别对应母种的‘意识核心’‘能量核心’‘连接核心’。晚星，你用宇宙之心的星时符文攻击中央节点，我和苏沐阳牵制左右节点，墨渊和焰阳负责防御周围的虚空残留生物！”五人的机甲立刻展开阵型，金色信念能量、赤色净化能量、暗金色寂灭能量、银紫星时能量在圣殿内交织成网。
“攻击——！”顾言琛的符文率先击中左上方节点，节点爆发出灰色光芒，护罩出现一道细纹。苏沐阳的信念能量紧随其后，右下方节点的光芒也开始闪烁。林晚星将光暗能量完全注入宇宙之心，星时符文化作银紫长矛，精准刺向中央节点——长矛穿透节点的瞬间，护罩剧烈震动，三道裂纹交汇成网，母种的黑色晶体暴露在空气中，表面的纹路开始疯狂闪烁。
“就是现在！”林晚星正要将净化能量注入母种，晶体突然爆发出强烈的灰光，无数黑色丝线从晶体中射出，朝着宇宙之心缠去——丝线竟与水晶表面的休眠纹路完美契合，开始牵引宇宙之心的能量。“不好！它在吸收宇宙之心的能量！”墨渊的反向寂灭能量化作利刃，斩断袭来的丝线，“母种和宇宙之心的能量同源，它在利用种子纹路建立控制！”
母种的晶体开始膨胀，表面浮现出初代的虚影，声音带着痛苦与威严：“平衡与虚空本是同源……宇宙之心与母种是‘一体两面’……摧毁母种，宇宙之心也会受损……”虚影突然消散，母体的残魂接管了晶体：“蠢货！初代就是想让你们顾忌这点！今天我就要用宇宙之心的能量，让所有种子彻底觉醒！”晶体爆发出的灰光将林晚星的机甲笼罩，宇宙之心的休眠纹路突然苏醒，开始与母种同步跳动。
“星时符文——反向牵引！”林晚星的精神海与宇宙之心深度连接，回忆起母亲影像中“用羁绊能量主导共鸣”的提示，她将墨渊、苏沐阳等人的能量都接入星时符文，银紫光芒暴涨，竟开始反向拉扯母种的能量。“不可能！你怎么能操控同源能量！”母体的残魂发出尖叫，晶体的膨胀速度减慢，表面出现细密的裂痕。
“因为平衡不是‘消灭’，是‘引导’。”林晚星的光暗能量顺着丝线流入母种，将里面的虚空本源能量逐渐净化，“初代没毁掉母种，就是想留下净化它的可能。你的本源能量本是纯净的，只是被‘吞噬欲’污染了！”母种的晶体在净化中逐渐变得透明，里面的灰色能量被剥离，化作纯净的能量融入宇宙之心，水晶的金色光芒比之前更璀璨。
就在母种即将被完全净化时，圣殿突然剧烈震动，顶部的石块纷纷坠落，顾言琛的操控台疯狂报警：“空间稳定性降到10%！001宇宙的核心正在崩塌，我们必须在五分钟内撤离，否则会被卷入空间裂缝！”林晚星看向手中的母种——晶体已变成淡金色，表面刻着与宇宙之心相同的星时符文，但内部还藏着一丝微弱的灰光，“母种的意识还没彻底消散，它在引发空间崩塌！”
“先撤出去再说！”苏沐阳的信念能量化作护罩，挡住坠落的石块，“起源之地传来消息，部分平行宇宙的种子已经停止生长，母种的能量被压制了，我们的目的基本达成！”墨渊的机甲将林晚星护在身后，反向寂灭能量注入圣殿的防御符文，暂时稳住崩塌的趋势：“圣殿的后门有紧急跃迁通道，是初代留下的，快！”
五人的机甲顺着通道狂奔，身后的圣殿在空间崩塌中化为碎片。当他们冲入跃迁通道的瞬间，林晚星回头望去——001宇宙的核心已变成一个巨大的黑色漩涡，母种的淡金色晶体从漩涡中飞出，朝着宇宙之心追来，晶体表面的灰光突然爆发出刺眼的光芒，投射出最后一段影像：无数种子在平行宇宙的能量节点开花，花朵中心浮现出“虚空母体”的标志，而宇宙之心的核心，竟也开出了一朵相同的花。
跃迁通道的光流突然紊乱，母种的晶体撞在通道壁上，与宇宙之心彻底融合——水晶表面的花朵与晶体的花朵重叠，爆发出强烈的能量冲击波，林晚星的精神海瞬间涌入海量信息：那是初代的完整记忆——宇宙之心与母种本是“宇宙本源”分裂而成，虚空母体是“本源的负面情绪集合体”，而那些种子，其实是“本源的修复因子”，但被母体扭曲成了破坏工具。
“原来……我们一直误解了种子的作用。”林晚星的机甲被冲击波震得失去控制，通讯器里传来苏沐阳的呼喊：“晚星！坚持住！通道出口就在前方！”她强行稳住精神，看向融合后的宇宙之心——水晶中心的花朵开始结果，一枚银色的果实正在成型，表面刻着“平衡修复”的符文。
当机甲冲出跃迁通道，起源之地的星空映入眼帘，所有伙伴都在港口等候。但林晚星没有放松——宇宙之心的果实突然裂开，露出里面的纹路，竟与之前在001宇宙看到的“时空锁”符文完全一致。与此同时，起源石碑突然发出轰鸣，表面的种子纹路全部亮起，组成一个巨大的阵法，将整个起源之地包围。
“这不是攻击阵！”林疏影的时间能量注入石碑，“是‘修复阵’！种子在响应宇宙之心的果实，它们在修复起源之地被虚空腐蚀的能量脉络！”但话音刚落，宇宙之心的果实突然射出一道银光，击中起源石碑的顶端——石碑上的阵法突然变了，无数银色符文朝着天空飞去，在星空中组成一个巨大的门形轮廓。
“这是……‘本源之门’！”林玄前辈的声音带着震惊，“初代的记载里，这扇门连接着‘宇宙本源空间’，只有当宇宙之心与母种完全融合，并且种子完成修复使命时才会开启！门后面藏着解决虚空危机的终极答案，但也可能……藏着更可怕的秘密。”
门形轮廓逐渐凝实，里面传来温和的能量波动，却也夹杂着一丝若有若无的黑暗气息。林晚星握着融合后的宇宙之心，感受到门内传来的召唤——那是本源的力量在指引。就在她准备踏入大门的瞬间，宇宙之心突然警示，投射出门内的模糊影像：一片纯白的空间中，一个与林晚星长得一模一样的身影悬浮在中央，周身环绕着平衡与虚空交织的能量，看到林晚星时，身影缓缓抬起手，做出了“过来”的手势。