“方舟”组织的成员训练有素，配合默契。他们很快就控制住了局面，将大部分小型变异怪物消灭干净。林坤分裂出来的最后一只小型变异怪物，想要朝着核心装置冲去，被一名“方舟”组织的成员一枪击中，身体瞬间融化。
战斗终于暂时结束了。车间内一片狼藉，到处都是变异者的尸体和队员们的血迹。联合队伍损失惨重，三十余人只剩下不到十人，而且每个人都身受重伤。石虎因为伤势过重，已经陷入了昏迷。黑鹰的一条腿被打断，靠在墙壁上，脸色苍白。
一名穿着白色制服的中年男人走到林默的身边，他的脸上带着一丝悲伤：“你就是林默吧？我是你父母的同事，我叫张远。”
林默看着张远，眼中充满了疑惑：“你们……为什么会在这里？”
张远叹了口气，说道：“我们一直在关注着母体样本的动态。林坤激活母体样本网络后，我们就知道，这里会发生一场大战。我们之所以现在才出现，是因为我们需要时间准备专门对付变异生物的武器。”他顿了顿，继续说道：“你父母是伟大的科学家，他们为了保护净化力量，付出了太多。现在，净化力量在你的身上，你必须承担起保护人类的责任。”
林默握紧了拳头，心中的信念更加坚定。他知道，这不是结束，而是开始。
张远看了看车间中央的核心装置，说道：“我们需要摧毁这个核心装置，彻底切断母体样本网络的能量供应。不过，这个装置的能量非常强大，强行摧毁可能会引发爆炸，波及整个城市。我们需要时间来制定安全的摧毁方案。”
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林默点了点头：“好，我们会配合你们。”
接下来的时间里，“方舟”组织的成员开始对核心装置进行检测和分析，林默则带领剩下的队员，在车间内进行休整和救治伤员。陈宇虽然没有受伤，但也吓得不轻，他一直跟在林默的身边，帮着照顾伤员。
就在“方舟”组织的成员即将制定出摧毁方案的时候，车间的地面突然开始震动，核心装置上的蓝光变得越来越亮。张远的脸色变得凝重起来：“不好！核心装置的能量开始不稳定了！可能是林坤刚才的攻击造成了损坏！”
林默心中一沉：“那现在怎么办？”
“只能强行摧毁了！”张远说道，“但这样一来，必然会引发巨大的爆炸。我们必须尽快撤离这里！”
所有人立刻开始撤离。林默背起昏迷的石虎，黑鹰则在两名队员的搀扶下，艰难地朝着车间外走去。“方舟”组织的成员在核心装置上安装了炸药，然后也跟着撤离。
当所有人都撤离到工厂外的安全区域后，张远按下了引爆按钮。“轰隆”一声巨响，巨大的爆炸冲击波席卷了整个工厂，工厂的墙壁和屋顶纷纷倒塌，烟尘滚滚，遮天蔽日。
所有人都被冲击波掀飞出去，摔在地上。林默挣扎着从地上爬起来，朝着工厂的方向望去。他能感觉到，母体样本网络的能量正在快速消失，周围的变异者气息也变得微弱起来。
就在这时，他突然感觉到，一股更加古老、更加强大的气息，从工厂的废墟深处散发出来。这股气息不同于林坤和变异巨兽的邪恶气息，它更加威严，更加恐怖。林默的心中充满了恐惧，他知道，爆炸不仅摧毁了核心装置，还可能唤醒了某种沉睡在地下的可怕存在。
张远也感觉到了这股气息，他的脸色变得惨白：“这……这是什么气息？难道……难道传说中的‘深渊领主’是真的？”
林默不解地问道：“深渊领主是什么？”
张远颤抖着说道：“根据我们的研究资料记载，在末世爆发之前，地球上就存在着一种古老的生物，它们被称为‘深渊领主’，拥有毁天灭地的力量。后来，它们被封印在了地下深处。没想到，核心装置的爆炸竟然把它唤醒了！”
工厂的废墟开始剧烈震动，一只巨大的爪子从废墟中伸了出来，爪子上布满了锋利的鳞片，散发着黑色的光芒。紧接着，一个巨大的头颅也从废墟中探了出来，它的眼睛像两颗巨大的红宝石，口中不断地喷射出黑色的火焰。
深渊领主发出一声震耳欲聋的嘶吼，整个城市都在为之颤抖。周围的变异者纷纷朝着深渊领主的方向跪拜，仿佛在迎接它们的王。林默和张远等人都露出了绝望的神色，面对如此可怕的存在，他们的力量显得如此渺小。
深渊领主缓缓地从废墟中走出来，它的体型比之前的变异巨兽还要庞大十倍，身上散发着让人窒息的威压。它的目光扫过林默等人，然后朝着城市的中心方向走去。所过之处，地面塌陷，建筑倒塌，一片狼藉。
林默握紧了手中的钢筋，心中的绝望渐渐被一股不屈的意志取代。他知道，无论前方有多么艰难，他都不能退缩。为了保护聚居点的居民，为了保护所有在末世中挣扎求生的人，他必须战斗到底。
张远走到林默的身边，说道：“深渊领主的力量太过强大，我们根本无法对抗它。现在，我们唯一的希望，就是找到你父母留下的另一份研究资料，里面可能记载着对抗深渊领主的方法。这份资料被藏在城市东郊的一个秘密实验室里。”
林默点了点头：“好！我们现在就出发，去寻找那份研究资料！”
就在他们准备出发的时候，天空中突然出现了一道巨大的裂缝，裂缝中不断地有黑色的雾气涌出，无数只长相怪异的生物从裂缝中跳出来，朝着地面上的人类发起了攻击。张远的脸色变得更加惨白：“不好！深渊领主的苏醒，竟然撕裂了空间，打开了通往深渊的通道！”
林默抬头望着天空中的裂缝，心中充满了沉重。他知道，一场更加残酷的战斗，已经拉开了序幕。而他们，将是人类最后的希望……
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