第三关“包容”的密室是一片星空幻境，幻境中，众人看到了暗影族滥用能量引发危机的场景，看到了上古守护者封印暗影核心的惨烈战斗，还看到了熵能生物袭击联盟星域的画面。幻境的中央，站着一名身着灰色长袍的老者，正是熵能的意识化身。“你们看到的，都是宇宙平衡被打破的瞬间。”老者的声音回荡在密室中，“包容不是原谅错误，而是理解错误背后的原因。你们能包容暗影族的过错，包容熵能的存在，包容宇宙的不完美吗？”
林凡走上前，看着幻境中暗影族成员因能量失衡而痛苦的表情：“暗影族的错误，源于对能量的无知；熵能的泛滥，源于起源核心的突然觉醒；宇宙的不完美，才是它不断进化的动力。包容这些不完美，才能真正理解平衡的意义。”他伸手触碰幻境，将平衡能量注入其中，幻境中的战斗场景逐渐变化，守护者们不再封印暗影核心，而是与暗影族共同研究能量调控技术，熵能与平衡能量相互配合，让宇宙的能量体系更加稳定。
当幻境中的宇宙呈现出灰金色的平衡状态时，第三道石门终于打开，露出通往契约大厅的通道。通道的尽头，一名身着灰金相间铠甲的人形生物正站在中央，他的周身环绕着灰金色的能量场，正是平衡仲裁者。“你们通过了试炼，证明了你们有资格持有宇宙平衡契约。”仲裁者的声音威严而温和，伸手一挥，大厅中央的石台上，出现了一卷金色的卷轴。
林凡走上前，打开卷轴，卷轴上的上古文字自动转化为联盟通用语，记载着宇宙中所有能量族群的权利和义务——平衡守护者有责任调控能量分布，暗影族有权利使用暗影能量但需接受监管，熵能族群有义务维持熵能浓度稳定，各文明需共同维护能量网络的安全。卷轴的最后，留有所有能量族群的签名位置，等待新的守护者签名确认。
“契约需要所有能量族群的认可才能生效。”仲裁者解释道，“目前，平衡联盟代表平衡守护者，星蛇族代表晶壁行者，熵能的意识已融入起源核心，暗影族的意识残魂还在沉睡。只有唤醒暗影族的意识残魂，让其签名，契约才能彻底生效。”
就在此时，归衡号的紧急通讯突然接入，冯旭平的声音带着焦急：“星道监测站发来警报！遗忘古墟外围出现大量未知战舰！这些战舰的能量波动与暗影族相似，但更加狂暴！它们正在攻击监测站！”仲裁者的脸色骤变：“是‘暗影叛逆者’！它们是暗影族中拒绝接受平衡的激进分子，在上古战争中被封印在古墟外围，能量波激活了它们的封印！”
众人立刻返回归衡号，舰桥的屏幕上显示，数百艘黑色的战舰正在围攻监测站，战舰的舰身布满了尖锐的骨刺，主炮释放的暗紫色能量束威力惊人，已摧毁了三座监测站。“这些战舰的能量核心是‘狂暴暗影晶’，能吸收熵能强化自身！”凯伦的花瓣显示屏快速分析数据，“它们的目标是契约大厅！想要夺取平衡契约，掌控宇宙能量！”
“仲裁者，契约能暂时强化我们的能量吗？”林凡问道。仲裁者点头，伸手释放出一道灰金色能量，注入归衡号的主炮：“契约的能量能让平衡能量与熵能完美融合，形成的‘共生能量’是暗影叛逆者的克星！但需要有人守住契约大厅，防止它们直接夺取契约！”
“凌月带领晶卫族战士守住契约大厅！凯伦、鳞澈跟我指挥舰队反击！旋启，你带领破障舰群牵制敌人的左翼！”林凡果断下令，归衡号的主炮汇聚灰金色的共生能量，朝着暗影叛逆者的旗舰射去。能量束击中旗舰的瞬间，舰身的狂暴暗影晶开始不稳定，引发剧烈爆炸。
暗影叛逆者的舰队见状，立刻改变战术，释放出大量的暗影无人机，如蜂群般朝着归衡号袭来。“净化舰释放变异净化藤！”木华下令，经过灰金色能量变异的净化藤快速生长，藤条上的灰色纹路能吸收暗影能量，将无人机纷纷缠住，转化为共生能量。旋光号则释放出轨道能量刃，切断了无人机的信号传输，使其失去控制。
战斗进行到白热化阶段时，暗影叛逆者的旗舰突然突破防线，朝着巨型金字塔飞去，舰身释放出一道巨大的暗影能量网，试图笼罩金字塔。“不好！它们要直接夺取契约！”林凡立刻下令归衡号全速拦截，同时联系凌月：“守住契约！我们马上赶到！”
凌月带领晶卫族战士在金字塔周围构建了能量防御阵，暗影能量网撞击防御阵的瞬间，阵图剧烈震颤，晶卫族战士的脸色纷纷苍白。“用契约的能量强化防御！”仲裁者的声音从通讯器传来，凌月立刻将平衡能量注入契约卷轴，卷轴释放出一道金色的能量屏障，将暗影能量网反弹回去，击中旗舰的舰身。
归衡号趁机发射主炮，共生能量束直接击中旗舰的能量核心，旗舰的舰身开始逐渐瓦解。暗影叛逆者的首领见大势已去，发出一道狂暴的暗影能量，试图与金字塔同归于尽。“用共生能量形成能量茧！”林凡下令，所有战舰同时释放共生能量，形成一道巨大的灰金色能量茧，将暗影能量包裹其中，使其无法扩散。
当能量茧中的暗影能量被彻底净化时，契约卷轴突然飞出归衡号，悬浮在古墟的上空，释放出一道巨型的灰金色能量波，波范围内的暗影叛逆者战舰纷纷失去动力，舰身的狂暴暗影晶被转化为稳定的暗影能量。“契约生效了！”仲裁者的声音带着激动，“它在自动净化狂暴的暗影能量！”
能量波扩散到古墟外围时，一道暗紫色的光影从封印中浮现，正是暗影族的意识残魂。他看着契约卷轴，眼中充满了复杂的情绪：“上古战争的错误，终于可以弥补了。”他伸手在卷轴上留下自己的签名，卷轴的光芒更加耀眼，将暗影能量、平衡能量和熵能完美融合，形成一道覆盖整个古墟的能量网络。
战斗结束后，仲裁者走到林凡面前，将一枚灰金色的徽章交给她：“从今天起，你就是宇宙平衡的‘总守护者’，负责协调各能量族群的关系。契约已经与起源核心和熵能之心绑定，会自动调控宇宙的能量平衡。”他顿了顿，继续说道：“但你们要记住，宇宙的平衡不是一成不变的，未来还会出现新的能量形态，新的危机，你们的使命永远不会结束。”
先遣队返回极光星域时，契约生效的消息已经传遍了整个宇宙。暗影族的意识残魂与联盟建立了联系，承诺会约束族内的激进分子，共同维护能量平衡；星蛇族的母星在共生能量的滋养下，熵能侵蚀区逐渐恢复，蓝色的晶体山脉重新焕发生机；各族文明纷纷派出代表，在契约卷轴上签名，平衡联盟的规模扩大到数百个文明。
在联盟的庆功仪式上，林凡站在能量塔的顶端，看着下方各族文明的代表，手中的灰金色徽章与起源核心产生共鸣，释放出柔和的光芒。“今天，我们不是庆祝危机的结束，而是庆祝一个新时代的开始。”林凡的声音通过能量网络传遍整个宇宙，“宇宙的平衡需要所有文明共同守护，未来的道路还很漫长，但只要我们团结一心，就没有克服不了的困难。”
庆功仪式结束后，林凡接到了仲裁者的通讯，通讯中，仲裁者的影像带着凝重：“契约检测到宇宙边缘出现了新的能量波动，这种能量不属于平衡、暗影、熵能中的任何一种，可能是来自‘域外宇宙’的能量。新的挑战已经出现，你们准备好了吗？”
林凡看着星图上宇宙边缘的未知区域，眼中闪烁着坚定的光芒。他转身对舰桥的众人说道：“归衡号准备起航！目标，宇宙边缘！去探索新的未知，守护我们的宇宙！”归衡号的引擎再次启动，朝着遥远的星空疾驰而去，舰身后，是各族文明组成的庞大舰队，他们跟随着总守护者的脚步，共同迈向充满未知与挑战的未来。
航行途中，林凡掌心的徽章突然亮起，投射出一段影像：域外宇宙的能量形态与本宇宙的能量相互碰撞，形成一道绚丽的彩虹桥，桥的另一端，站着数名形态各异的生物，他们的眼中充满了好奇与友好。“看来，我们不仅要面对挑战，还会遇到新的朋友。”林凡微笑着说道，归衡号的速度再次提升，朝着彩虹桥的方向疾驰而去，开启了宇宙探索的新篇章。