陶成章本来建议部队分散。蔡元培坚决反对，他要求光复会明目张胆的退据青田。段祺瑞对在南部浙江活动的光复会不理不睬。这看似完全不可靠的“和谈”居然成功了。光复会上下对疏远已久的蔡元培都生出了信赖。
光复会不仅在等待，这些历经考验的坚定骨干们全部参与到光复会未来方向的大讨论中。战肯定是战不过北洋的。经历好几次生死考验的光复会成员，特别是那些被释放不久的光复会成员充满了厌战情绪。
在陶成章的统领下，光复会经历了不少失败。不过这些骨干们并没有想把陶成章彻底否定，特别是徐锡麟和秋瑾坚定支持陶成章。会议上“反对陶成章左倾冒险主义路线”的批判虽然比较激烈，但是也没到一定要把陶成章打倒的地步。
徐锡麟联合在安徽参与农村地方工作的光复会同志，经过商讨，提出“联合人民党。共同发动人民革命”的观点。在徐锡麟看来，这个观点一度得到了不少人明确支持，以及相当一部分人的默许。至于革命工作开展地，徐锡麟认为到紧挨安徽的浙江长兴县展开工作比较合适。
这个提议立刻遭到了蔡元培的激烈反对。蔡元培表示，“既然已经与袁世凯达成了协议，那么近期不合适到浙江西北展开工作。”
“北洋根本就不会在乎那么偏远的一个山区。背后还是人民党的地盘，段祺瑞更不会自找麻烦。”徐锡麟拼命的劝说同志们。
光复会同志们好不容易得到了休整机会，大多数并不赞成与北洋再起任何冲突。而且在杭州战役中，徐锡麟并没有参加，不少人完全忘记了他们在南京把徐锡麟抛在死地这件事，反倒对徐锡麟等人没能回援杭州耿耿于怀。
一般来说，一个政治组织如果有强势领导人，例如满清的慈禧，北洋的袁世凯，人民党的陈克，在这种时候还是能够强势引导政策的。可光复会从来不是一个真正意义上的利益集团，作为一个革命家与会党们的结合体，光复会只是靠个人威望或者资历形成的团伙，从没没建立起过有效的组织体系。伴随革命进程的发展和挫折，个人威望也在起起伏伏中形成了倾向蔡元培、陶成章、徐锡麟的三派。
这种会议一旦进入僵局，就很难再打开局面。徐锡麟和陶成章秉持着一贯的豪杰兼率性读书人的狷介特点，都不愿意用自己的名望来塑造组织制度。在这种时候，两人都认为当务之急是先达成共识，团结同志。
反倒是蔡元培毫不客气的开始争夺起主导权来。作为光复会的创始人之一，蔡元培之所以后来不愿意与光复会在一起，就是讨厌这种江湖气。不管同盟会有什么问题，同盟会本身起码有一个优点，那就是能够以全中国的角度考虑问题。虽然说无法理论的说清楚此事，蔡元培就是不能接受陶成章与徐锡麟这种“小家子气”。
不过蔡元培毕竟没有领导过武装斗争，大家能接受蔡元培作为创始人的地位，可还是不能接受其全面领导。不懂军事的人统领军事的结果，这些出生入死的战士们太清楚了。
袁世凯夺取北京政权的消息一出，震动了天下。光复会守到的震动尤其大。一直困扰着光复会的最大问题，“袁世凯为什么要和光复会达成如此宽容的协议”，在光复会中立刻达成共识。准备推翻满清的袁世凯是发自内心不愿意把兵力投放在与光复会这些革命党的战争中。
光复会本来的政治主张就是打倒满清，恢复汉家天下。至于这汉家天下是哪家的天下，光复会也没有确定的打算。
在惊讶、怀疑中，另外一个消息传到了光复会，袁世凯有意实施联省自治。听到这个消息，光复会上下彻底沸腾了。“联省自治”意味着谁是地方上的主宰，谁就能够成为未来的浙江主宰。不管段祺瑞本人到底掌握了何种军事力量，可段祺瑞不可能控制议会。光复会才是未来浙江的主宰。
在这个背景下，与袁世凯谈判的蔡元培地位陡然上升。而蔡元培本人也坦承，就现在得知的局面，联省自治未必是议会制。如果不能在浙江实施议会制度，光复会还是没有能力掌握浙江。蔡元培本人愿意为了光复会的利益，为了浙江的利益，与袁世凯尽量磋商。
经过讨论之后，光复会接受了蔡元培的建议，模仿同盟会的模式，并且吸收了一些人民党的组织特点，完全推翻了原先陶成章与徐锡麟领导光复会时的“豪杰联盟”模式。不管监察体系和纪律维护水平如何，光复会至少在组织上建成了一个等级明确，责任明晰的政党。
在蔡元培跟着孙中山混同盟会的时候，实际革命工作上并没有丝毫进展。但是对于现代组织的认知可以说有着飞跃式的进展。孙中山是为了获得权力而去忽悠别人，正因为没有基层，而且还要用组织来忽悠别人，所以孙中山反倒能够放下包袱轻装上阵，很多基于理论上的幻想也不能说没有可取之处。
如果只有蔡元培一人的努力自然是不行，光复会本身经过这么多的实际斗争，上下也感觉也需要一次整顿。混合着对效率的追求，厌战，对战友们的认同感，对未参加革命的其他势力的厌恶，对权力的渴望。在这些情绪的共同作用下，蔡元培拿出的“光复会政党化，夺取联省自治中浙江的主导权”的策略几乎满足了光复会上下的所有需求。
对于光复会的近期动向，人民党研究小组综合了近期的资料，在陈克带领下终于分析出了阶段性结果。小组成员对此结果即意外又不意外。在满清实际上覆灭之后，政党化的光复会几乎不可避免的要走向人民党的对立面。这是双方失去了共同的敌人之后的必然发展。研究小组里头不少都是高级干部，他们早就知道陈克认为光复会“比较反动”，满清这个最反动的对象被打倒之后，其他各个势力也从“比较进步”向着“比较反动”快速转化了。
“那么陈主席，你认为最近的局面会怎么转化”齐会深问道。光复会试图投向袁世凯，至少会试图与袁世凯达成某种政治合作已经不再奇怪。不过他们