双方正在僵持，殿外传来一阵急促的脚步声和威严的喝令：“何事喧哗？！”
众人回头，只见李渊在李建成、李世民、裴寂等文武簇拥下，已匆匆赶至东宫。他显然已得知找到代王的消息，亲自前来处置。
李渊步入殿中，目光迅速扫过场景，看到被姚思廉护在身后、瑟瑟发抖的杨侑，又看到挺身而立、怒目而视的姚思廉，以及那队进退维谷的士卒，心中已明了大半。
他挥手示意士卒退下，然后整理了一下衣冠，缓步上前，对着杨侑的位置，躬身长揖，语气恭谨：“臣李渊，救驾来迟，令殿下受惊，万死之罪！”
这一拜，姿态放得极低，完全是以臣子见藩王的礼节。杨侑哪里经历过这个，吓得往后缩了缩，不知所措。
姚思廉见李渊如此作态，心中稍定，但仍未放松警惕，侧身让开，却依旧站在杨侑身侧可及之处。
李渊直起身，温言对杨侑道：“殿下，逆臣宇文化及欺君于江都，陛下身边奸佞横行。渊不忍宗庙倾覆，社稷丘墟，故纠合义兵，欲迎殿下正位，肃清朝纲，再兴大隋。今幸赖将士用命，克复西京。请殿下移驾大兴殿后阁暂居，以安天下之心。”
这番话，将他攻入大兴城的行为，彻底包装成了“迎立代王、匡扶隋室”的正义之举。杨侑年幼，唯唯诺诺，哪里敢有异议。
李渊又转向姚思廉，面露赞许之色：“姚侍读忠贞护主，临危不惧，真乃士林楷模。渊感佩之至。便请姚侍读，扶殿下移驾吧。”
姚思廉深深看了李渊一眼，见他态度诚恳，礼仪周全，暂时确无加害代王之意，这才躬身应道：“遵命。”他转身，小心翼翼地扶起杨侑，低声道：“殿下，请随臣来。”
杨侑如同木偶般，被姚思廉搀扶着，一步步走出东宫偏殿，穿过熟悉又陌生的宫苑廊庑，前往大兴殿后方的顺阳阁。一路上，所见尽是陌生的唐军甲士和惶惶不安的宫人，昔日隋宫的威严与秩序，已荡然无存。
行至顺阳阁下，姚思廉停住脚步。他知道，送到这里，他的使命暂时告一段落，接下来，代王将成为李渊手中的政治傀儡，而自己，一个前朝侍读，已无力改变什么。
他松开搀扶杨侑的手，后退两步，整了整衣冠，然后对着这个自己教导数年的少年藩王，郑重地跪拜下去，以头触地，久久不起。再抬头时，这位以刚直着称的文士，已是泪流满面，声音哽咽：“殿下……保重！臣……就此拜别！”
他深知，这一别，或许便是君臣永诀。他所效忠的大隋，实质上已经终结，而他所护卫的这位少年亲王，未来的命运，完全掌握在眼前这位“唐公”手中。
杨侑看着跪地哭泣的姚思廉，似乎也感受到了某种诀别的悲凉，眼圈一红，也掉下泪来。
李渊在旁看着这一幕，心中亦是复杂，但他并未多言，只是示意左右宫人，好生扶代王入阁安顿。姚思廉则被客气地“请”出了皇宫，李渊并未为难他，反而令有司厚赠金帛，许其归家。姚思廉拒而不受，只身离开，从此闭门着书，不问世事。此为后话。
控制全城后，李渊并未入住皇宫，而是选择了城东的长乐宫旧址作为行辕。此举既是避嫌（不立刻僭居皇宫），也是向天下表明自己“尊隋”的立场——皇宫是代王的居所。
此刻，长乐宫正殿被临时布置为议事之所。李渊端坐主位，听着各路将领汇报战果、清点损失、禀报擒获。
战果是辉煌的：大兴城，这座天下中枢，已落入手中。守军大部溃散投降，顽固分子被肃清。缴获府库钱粮、器械、文书无数。
损失亦不小：攻城数日，唐军伤亡逾万，其中战死者多达五六千，伤者无数。孙华等将领阵亡，更是令人痛惜。
更重要的是人员的处置。卫文升在城破前夜，已因年老病重，兼之忧惧交加，咯血而亡，算是逃过了被俘受辱。但阴世师、骨仪等守城核心官员，以及一批坚决抵抗的中下级军官，共计十余人，已被擒获，押至殿下。
阴世师面色灰败，却仍强自挺直腰杆；骨仪则神情萎顿，喃喃自语。其余人等，或愤慨，或恐惧，或茫然。
李渊目光冰冷地扫过这些人。他缓缓起身，走到殿中，声音不高，却带着彻骨的寒意：“阴世师、骨仪，尔等可知罪？”
阴世师昂首道：“李渊！尔身为隋臣，举兵反叛，围攻帝都，才是真正的逆臣贼子！我等守土有责，何罪之有？只恨未能将尔等叛贼歼灭于城下！”
“好一个守土有责！”李渊怒极反笑，“尔等所守，是何人之土？是那远在江都、昏聩暴虐、致使天下分崩的杨广之土？还是这关中百万渴望安宁的百姓之土？”他声音陡然提高，“杨广无道，宇文化及欺君，天下板荡，生灵涂炭！我李渊起兵，乃为解民倒悬，迎立代王，再兴社稷！此乃大义所在！尔等不识时务，顽抗天兵，致使帝都遭此兵燹，军民死伤无数，此罪一也！”
他顿了一顿，眼中恨意如刀：“我李渊在太原起兵，尔等留守西京，竟敢发我李氏祖坟，毁我五代宗庙！此等掘坟毁庙、辱及先人之暴行，天人共愤！此罪二也！”
“尔等身为朝廷重臣，不思安抚百姓，反而在城中横征暴敛，贪酷苛虐，民怨沸腾！此罪三也！”
李渊每说一罪，声调便高一分，到最后已是声色俱厉：“三罪并罚，尔等还有何面目立于天地之间？！来人！将阴世师、骨仪等一干首恶，推出去，斩首示众！传首各门，以儆效尤！其家产抄没，眷属……暂且收押，另行处置！”
“李渊！你不得好死！”阴世师破口大骂，被士卒粗暴地拖出殿外。骨仪等人或哭喊求饶，或面如死灰，皆被押走。
片刻后，殿外传来数声凄厉的惨叫，旋即归于沉寂。十余颗血淋淋的人头被盛在木盘中呈上验看。李渊面无表情地挥挥手，令人传首四方。
殿中一片寂静。李渊以雷霆手段处决前朝核心抵抗分子，既是报仇雪恨，更是立威，清除潜在的反对力量，同时也向所有观望的旧隋官员传递了一个明确信号：顺我者昌，逆我者亡。