昭武十三年秋，少林寺塔林深处，一名灰衣僧人匆匆走进方丈禅房，低声道：“方丈，官府又在查‘白莲教’了，说是要在嵩山设‘戒律院’，管着我们出家人！”方丈慧明大师捻着佛珠，叹了口气：“自打新皇禁了淫祀，又改寺观为义学医馆，咱们佛门的日子是越来越紧了……”
一、区分“正教”与“邪教”：给宗教套上“缰绳”
李昊的宗教整顿并非“灭佛毁道”，而是“正本清源”——承认佛教、道教的文化价值，却坚决剥离其政治野心和对社会的负面影响。他在御书房对沈墨说：“儒家讲‘敬鬼神而远之’，朕也如此。宗教可以劝人向善，但不能干预朝政；可以修行养心，但不能蛊惑百姓。”
为此，礼部颁布《宗教管理条例》，明确“正教”与“邪教”界限：
正教（佛教、道教）：承认其“劝善化民”作用，允许公开传教，但需遵守三条铁律：①僧人道士需登记造册，剃度/出家需官府批准；②寺庙道观财产不得超过五百亩（超出部分充公）；③不得修建奢华佛像/神像（高度不得超过三丈）；
邪教（白莲教、弥勒教等）：严禁一切活动，凡聚众传教、制造谣言者，以“谋反罪”论处；窝藏邪教者，与邪教徒同罪。
为体现“弘佛法辅王化”，李昊特批少林寺、武当山为全国佛教、道教中心，设“僧伽大学”“道教学院”，培养“有文化的僧道”——课程除佛经道藏外，必修《昭武律》《算术》《农桑辑要》，毕业僧道可任地方寺观住持或义学教师。
少林寺方丈慧明大师接到“设戒律院”的圣旨时，内心抵触：“我少林以武闻名，如今却要学那些酸秀才，岂不丢了根本？”戒律院首任院长、原军事学院教官赵虎（已剃度为僧，法号“觉明”）却另有看法：“方丈，武僧打拳练武是为了强身健体，如今新军有了火器，拳头再硬也不顶用。咱们学算术、学医术，帮百姓修桥铺路，才是真正的‘普度众生’。”
戒律院的课程让僧人们大开眼界：《工程数学》教他们计算桥梁承重，《医学概要》教他们辨识草药，《昭武律》教他们分辨“合法传教”与“邪教煽动”。年轻僧人行觉（原少林俗家弟子）学得最快，他用几何知识改进了寺庙的排水系统，用针灸法治好了山下村民的头痛病，很快成了“明星僧”。
“以前我觉得当和尚就是念经打坐，现在才知道，佛法在世间，不离世间觉。”行觉对师父觉明说。慧明大师见弟子们一个个脱胎换骨，终于放下成见：“觉明说得对，咱们佛门要想长久，就得跟上王爷的脚步。”
白莲教残余势力趁宗教整顿之机，煽动信徒“反抗暴政”。他们在河南嵩县设“弥勒佛堂”，宣称“末日将至，唯有入教可得永生”，骗取百姓钱财，甚至强迫妇女入教为“圣女”。
李昊命河南巡抚刘铭传剿灭白莲教。刘铭传先用“谍报渗透”：派密探混入教中，摸清组织架构；再用“攻心为上”：张贴告示揭露白莲教“挖眼制药”“奸淫妇女”的罪行，瓦解信徒斗志；最后“雷霆出击”：趁教众集会时突袭佛堂，擒获教主王麻子及骨干三十余人。
公审大会上，王麻子狡辩：“我等只是劝人向善，何罪之有？”刘铭传当庭出示证据：从佛堂搜出的“圣女名册”、挖眼的匕首、伪造的“佛经”。百姓愤怒不已，高喊“杀了他！”李昊下旨“凌迟处死”，并将其罪行编成《邪教现形记》，在全国刊印散发。
道教以“养生”着称，李昊顺势将其纳入“民生体系”。武当山紫霄宫改为“道家养生学堂”，设“导引术”（气功）、“本草学”、“天文历法”三门课程，招收平民学员。学堂规定：年满六十岁的老人免费入学，学习养生之法，体弱者可获赠草药。
八十岁的陈阿婆患有哮喘，入学三月后，跟着道士练习“六字诀”（嘘、呵、呼、呬、吹、嘻），病情明显好转。她在结业典礼上说：“以前总觉得活着受罪，现在学了养生，每天打坐练气，能吃能睡，多活几年看看王爷的新政！”
“系统提示：宿主完成“宗教整顿第二阶段”，确立佛教道教“正教”地位，少林寺戒律院培养僧才50人，武当养生学堂惠及老人千余人，剿灭白莲教据点12处。民心值+12%（当前545%），解锁成就“宗教驯化者”。注意：道教“长生术”仍有迷信色彩，需引导向“养生科学”转化。”
秋深时节，少林寺的晨钟暮鼓依旧，却少了往日的肃杀之气，多了几分书卷香；武当山的道士不再只炼丹修道，而是在田间指导百姓种植药材。李昊对沈墨说：“宗教如水，能载舟亦能覆舟。朕要做的，就是给它挖一条河道，让它顺着河道流，滋润百姓，而不是冲毁堤坝。”