官军从多个方向，向水西、永宁核心地区同时推进。
此时叛军早已军心涣散，粮草不济，抵抗微弱。
永宁奢崇明在内讧中被其侄奢寅所杀，奢寅携其首级出降。
水西 安坤率残部退守最后的天险织金洞，被官军重重围困，断水断粮。
其部下大将安铨、安铉兄弟见大势已去，发动兵变，擒获安坤及其家眷，开洞投降。
安坤、奢崇明被押送北京，凌迟处死，家族成年男子尽诛，妇孺没官。
水西、永宁两地，彻底改土归流。水西设大定府、黔西府、平远府等，永宁设叙永厅，派流官治理。
其土地，部分没收，分给投降的土目、头人及屯垦军民；部分允许原耕作者继续耕种，但需向官府纳粮。
最后，怀柔湖广容美及其他中小土司。
在武力解决安、奢的同时，对容美宣慰使田舜年，洪承畴则采取了截然不同的怀柔策略。
他亲自写信给田舜年，言辞恳切，肯定其家族“世守边陲，素有忠顺之名”，指出朝廷“改流”乃大势所趋，为的是“永绝边衅，共享太平”，并非针对田氏一家。
他承诺，若田舜年主动请辞土司之位，接受“改流”，朝廷将册封其为镇远将军、都督同知（虚衔），举家迁往武昌或北京居住，赐予宅邸田产，其子弟可入国子监，前程无忧。
对其部众，则保证一视同仁，其现有财产予以承认，并优先录用其子弟为吏。
与此同时，朝廷“抚夷使”对湖广、四川、贵州的其他中小土司展开了密集的游说和“赎买”。
朝廷开出价码：土司交出土地、人口、军队册籍，朝廷按其规模，一次性给予巨额“赎买银”（数万至数十万两不等），并授予其家族成员相应的世袭虚爵（如骑都尉、云骑尉）或流官职位（如知府、同知，但需异地任职），子弟有科举资格。
许多势力较弱、自知无法抵抗的土司，在威逼（安、奢覆灭的前例）利诱（巨额白银和官爵）下，纷纷上表，自愿“改流”。
田舜年权衡利弊，见强如安坤、奢崇明都已灰飞烟灭，朝廷开出的条件也的确优厚，继续抵抗只有死路一条。
最终，他接受了洪承畴的条件，主动上表请求“改土归流”。
朝廷兑现承诺，厚加封赏。容美土司辖地改为鹤峰州、长乐县等，顺利纳入流官体系。
至启明五年底，在洪承畴“武力打击首要，政治分化瓦解，经济赎买辅助”的多重手段下，西南“改土归流”取得了突破性进展。
最大的刺头水西安氏、永宁奢氏被铲除，车里刀氏被平定，容美田氏等一大批中小土司和平“改流”。
朝廷在云贵川湖广新增设府、州、县四十余个，流官统治区域大幅扩展，编入户籍的百姓增加了数百万。
虽然深山僻壤仍有少数小土司存在，西南民族问题也远未彻底解决，但延续数百年的土司割据局面已被打破，中央政权对西南边疆的控制力得到了空前的加强。
武力加怀柔，云贵归王化。
洪承畴以出色的政治智慧和军事手腕，基本完成了朝廷赋予的阶段性使命。
西南大地，正在经历一场深刻的社会变革，从“羁縻”走向“直接统治”。
帝国的版图与政令，前所未有地深入到了这片蛮烟瘴雨之地。
然而，帝国的边疆，从未真正平静。
在遥远的东北黑水白山之间，另一股阴魂不散的势力，正在与更北方的庞然大物悄然勾连，酝酿着新的风暴。