叶知秋面临艰难抉择：是集中能量抵御暗影族舰队，保住空间站这个唯一的合作平台，还是暂停防御，启动传送门将净化设备送往澳大利亚，阻止污染扩散？如果保住空间站，澳大利亚的污染可能会蔓延至全球，导致地球的能量供应彻底崩溃；如果救援澳大利亚，空间站的护盾一旦破裂，万倍空间技术被摧毁，地月火三线的支援将彻底中断，超级武器的启动将无人能挡。
“双线作战！”叶知秋猛地做出决定，“林岚，抽调30%的能量维持传送门，优先将净化设备送往澳大利亚；艾伦，调整护盾能量分配，重点保护核心舱与能量模块；露西，联系地球支援舰队，让他们立刻前往空间站支援！”
指令下达的瞬间，空间站的能量系统开始超负荷运转。传送门再次启动，蓝色的涟漪中，数十套净化设备被快速送往澳大利亚；护盾能量被重新分配，核心舱周围的护盾强度翻倍，而其他舱段的护盾则变得薄弱；地球轨道上的“神舟”级支援舰与欧洲“雅典娜”级支援舰立刻转向，朝着空间站疾驰而来。
暗影族舰队的攻击更加猛烈，一艘战舰突破了外层护盾，撞向空间站的实验舱，巨大的冲击力让实验舱的墙壁瞬间凹陷，部分设备被损毁，万倍空间场的紊乱更加严重。“实验舱受损！万倍空间技术的能量输出下降50%！”林岚大喊，“澳大利亚的传送被迫中断，还有10套净化设备没送出去！”
火星上，陈铭小队抓住暗影王分心干扰空间站的机会，发起了猛烈进攻。小李用重型能量炮牵制暗影王的注意力，老王趁机将便携式传送器放在核心碎片旁边，启动了与空间站的共鸣程序。“空间站！我们已锁定第五块核心碎片，请求空间传送支援！”陈铭大喊着，避开暗影王的能量束，朝着本源之水的水晶容器冲去。
暗影王察觉到了他们的意图，怒吼一声，放弃了对空间站的干扰，转身朝着陈铭扑来。金色战甲泛着红光，能量束如同暴雨般射向陈铭，陈铭的航天服后背被击中，瞬间炸开一个焦黑的洞口，鲜血喷涌而出，但他依旧没有停下脚步，伸手抓住了水晶容器的把手。
空间站内，叶知秋看着火星传来的画面，眼中闪过一丝决绝。“将剩余所有能量注入传送门！”他大喊，“优先传送核心碎片与本源之水，陈铭小队的安危……听天由命！”
传送门的蓝光暴涨，一道强烈的空间能量束射向火星。陈铭感觉到一股巨大的拉力，手中的本源之水水晶容器与远处的核心碎片同时被蓝光包裹。暗影王的能量束击中了陈铭的腿部，他踉跄着倒下，但依旧死死护着水晶容器。“快走！”陈铭对着小李和老王大喊，自己则朝着暗影王扑去，试图为传送争取时间。
核心碎片与本源之水被成功吸入传送门，朝着空间站疾驰而来。但暗影王的能量束也击中了传送门的能量场，空间涟漪瞬间紊乱，陈铭的身影被红色能量束包裹，消失在传送门的蓝光中。“陈铭！”小李撕心裂肺地大喊，却只能看着传送门关闭。
空间站内，核心碎片与本源之水成功抵达。林岚立刻将本源之水倒入特定容器，激活了净化频率的强化程序。“净化频率已升级！”她大喊，“可以一次性净化所有剩余污染源，还能彻底阻断月球矩阵的入侵！”
但此时，暗影族舰队的最后一击也击中了空间站的核心舱。护盾彻底破裂，核心舱的墙壁被炸开一个巨大的口子，联盟徽章从能量接口中弹出，蓝光黯淡下去。万倍空间技术的能量场开始收缩，扩容后的实验舱与储物舱以肉眼可见的速度缩小，部分未及时转移的设备被挤压成碎片。
“徽章能量耗尽！万倍空间技术即将失效！”艾伦大喊，“月球矩阵的入侵又开始加速，超级武器倒计时还有3小时！”
叶知秋捡起地上的联盟徽章，看着屏幕上成功净化的地球矿脉、逐渐稳定的月球矩阵，以及火星上小李和老王艰难突围的画面，心中清楚，这只是又一次阶段性的胜利。陈铭生死未卜，暗影王依旧掌控着火星能量塔，超级武器的威胁仍在。而万倍空间技术的失效，让后续的支援与反击变得异常艰难。
就在这时，成功传送回来的第五块核心碎片与本源之水产生了强烈共鸣，一道青色的能量流从碎片中涌出，注入联盟徽章。徽章的蓝光再次亮起，这一次，光芒中夹杂着淡淡的金色，核心舱内的远古纹路全部激活，屏幕上弹出一段新的远古文字：“空间共振，文明归一，终极战场在‘星核’，暗影之源藏于地核。”
叶知秋愣住了，“星核”与“地核”的线索让局势变得更加复杂。超级武器的3小时倒计时仍在继续，暗影族舰队的残余势力还在空间站周围盘旋，陈铭的失踪让火星任务失去了核心指挥。而“星核”与“地核”的秘密，又将人类文明推向了一个未知的深渊。
远处的宇宙中，远古舰队旗舰的红光再次锁定空间站，显然，暗影族并不打算给人类太多时间。“天枢号”的核心舱内，科学家们正全力修复万倍空间技术，试图利用核心碎片与本源之水的能量，让技术重新稳定。但所有人都清楚，接下来的3小时，将是人类文明有史以来最艰难的决战，而胜利的希望，似乎又一次变得渺茫。