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下忍、中忍、上忍、唯有突忍习得所有忍术堪称忍界第一修行者！
奈良：楠流、蒲生流、九州流、秀乡流、飞鸟流。
长野：伊藤流、青木流、芥川流、户隐流。
山形：羽黑流。新泻加治流、上杉流。
和歌山：纪州流、根来流、奈贺流、新楠流、名取流。
广岛：福岛流。
三重：泽流、泷野流、内川流、义森流、泷流、服部流、迁一务流、理极流、伊贺流。
爱知：全流、秋叶流。
山梨 ：忍甲流、忍光流、松田流、武田流、甲阳流。
枥木：松本流、福智流。
冈山：备前流。滋贺 甲贺流。
福井： 义经流。
神奈川：北条流。
青森 ：中川流。
众多流派在经历了多年历史长河与战火的洗礼后，绝大部分流派已经失传，剩下的只有寥寥无几的几个流派仍在延续着这门独特的战争艺术，不过令人感到欣慰的是，现今为数不多的流派中，已有流派抛弃原本不外传的门户之见，在为忍术成为世界的忍术而不懈努力着。伊贺，甲贺，纪伊，等叁州。其中后叁州的忍术在日本是最为发达的。
忍术教科书《万川集海》，原本在大和民族东征之前，伊贺跟甲贺两地是不分的，这里都被称作IGA。
后来因为在室町与战国时代，这两百年间地名分开，所以流派也慢慢分开啦！
不过虽然流派分开，可是忍者修练的经典却是同一本书，这本书人们叫做《万川集海》。这本书有着教导忍者如何施行忍术的一切理论基础与技能。
伊贺与甲贺离京都跟名古屋算是很近，而且位在重山险阻围绕的封闭小盆地里，自成一个小天地。可是在战略上的位置却是十分的重要.因为靠近日本的中央近畿地带，所以受到京都的文化影响蛮深的神社，寺院，庄园都很多.在后来庄园制度崩坏的时候，土豪们就一个个崛起在战国时代，这么小的土地居然有60个土豪，但是因为土地都很小，所以大家都想夺取对方的土地，于是每家人家大概都会养个30-40个兵，以便对付“敌国”.这里的竞争是超乎外人想象的激烈，土豪们互相结盟，互相探查敌情，也互相屠戮，被打击的土豪一但垮了，就很难再爬起，也难怪这种有山地，征战又激烈的地方，会成为忍术发展的大本营。
忍术和其他武术流派强调体质训练不同，它尤其强调精神上的修炼，并将其整个的训练体系，建立在超乎想象的精神修炼基础上。因为忍者所执行的大多是一去不回的高风险性任务，独自一人在敌人的巢穴中完成任务要克服对死亡、孤独、黑暗乃至于饥饿、寒冷、伤病等诸多困难，所以拥有强大的精神力量，是忍术之所以无坚不摧的真正原因。
作为一名忍者家族的后代，一经降生就必须接受残酷的命运现实——或者成为忍者，或者死。忍者从很小的时候起，就被灌输以对主人绝对忠诚的思想：除了自己的主人，任何人命令都不会听哪怕是日本天皇也不行。通过从小开始这种精神洗脑而打造出的忍者比任何的宗教信徒都更加狂热，更加无所畏惧。不过忍者也不是像邪教徒一样的僵尸般的战士，它有着一套切实可行的强大精神力量的训练方法。这种技术才是忍术的秘中之秘，它就是东密的修行。
东密和华夏的藏密，印度的杂密一样，是佛教中密宗的一个支派，而且东密对于人体念力的开发，向来有着自己独特的传承，在密教界一直以显着快捷着称，忍者通过东密秘法的修习，锤炼自己的意志，精神变得无比纯粹和坚韧，体内的潜能将得到最大限度的开发。可以完全除去心灵的迷惑和恐惧，全神贯注的投入战斗。此外密宗认为人的身体有许多奥秘和潜能，只要通过密宗法门的不懈努力就能使修行者发挥全部潜力，让身体与宇宙沟通达到天人和一的境界，这和忍者追求的极限体术不谋而合。密宗视大日如来为万物之主，极力推崇传承、真言和密咒。在一些影视作品或者漫画中经常可以见到忍者做出许多古怪的手势，那便是在表述东密主要修法之一的“九字秘印”：“临、兵、斗、者、皆、阵、列、在、前”这九字真言。
忍术对于身体训练的强度也是非常残忍的。忍术所包括的内容，每一项忍者都必须精通。并且每项训练，都全是死亡淘汰赛，无法承受的人是不允许生存的。除了常规训练外，忍术还包括多种“怪力训练”，忍者通过它进一步磨练意志，忍耐力，生存能力等等。这种怪力训练诸如连续数天不食不动，杀死自己的同伴，以及与猛兽搏斗等，是令人难以想象的。通过这些死亡率极高毫无人性的修行，忍者从精神到肉体都实现了超人的飞越。获得了超越常人的毅力、耐力、战斗力。通过忍术的训练而幸存的忍者，个个都是一部绝对可靠的全功率战斗机器。
幕府时代，忍者们干出的离奇惊险、令人咋舌的事件举不胜举，熊野寺秘籍被毁一事，可窥一斑。
熊野寺的主持拥有一本日本武功的秘籍，从不示人，一个名叫上野守直的武士千方百计想得到它。忍者堀川奉令行动，他打听出秘籍收藏在寺内一间小建筑里，寺庙戒备森严，无法进入。于是他花了七个月的时间，挖了一条地道通到小建筑底下，这时才发现，该屋建在一块大石头上，根本无法挖通。可熊野寺主持已经发现有人在挖地道想盗秘籍，他派人在地道口突然用火攻，将堀川活活烧死。上野又派了另一名忍者八郎去盗秘籍。八郎长得年轻貌美，且能歌善舞，他被当作侍童招进寺里，心术不正的僧侣将他打扮一番，当作同性恋的泄欲对象。