戊戌日，朝廷任命御史大夫孔纬、翰林学士承旨、兵部尚书杜让能同为兵部侍郎、同平章事。
保銮都将李鋋等人在凤州击败邠宁的军队。
朝廷下诏加封王重荣为应接粮料使，命他调拨本道的十五万斛粮食来供给朝廷使用。王重荣上表声称，只要田令孜没有被诛杀，他就不奉诏行事。
朝廷任命尚书左丞卢渥为户部尚书，兼任山南西道留后；任命严遵美为内枢密使。朝廷派遣王建率领所部士兵驻守三泉县，晋晖和神策军使张造率领四都的士兵驻守黑水，抢修栈道，以便于往来通行。朝廷还让王建遥领壁州刺史，将帅遥领州镇的制度，就是从这时开始的。
陈敬瑄猜忌东川节度使高仁厚，想要除掉他。遂州刺史郑君立起兵攻陷汉州，率军向成都进发。陈敬瑄派遣部将李顺之前去迎战，郑君立战败身亡。陈敬瑄又调发维州、茂州的羌族军队攻打高仁厚，将他杀死。
朱玫因为田令孜一直在僖宗身边，终究难以铲除，便对萧遘说：“皇上流离迁徙已经六年了，中原地区的将士们出生入死，百姓们供给军饷粮草，战死饿死的人，多达十分之七八，才勉强收复了京城。天下人正为皇上返回京城而高兴，皇上却把平定叛乱的功劳归于宦官，将大权交给他们，致使朝廷的法度纲纪遭到破坏，藩镇受到侵扰，最终招致祸乱。我昨天奉您的命令前来迎接皇上的车驾，不仅没有得到皇上的信任和理解，反而被当作胁迫君主的叛逆。我们这些人报效国家的忠心已经尽到了，讨伐贼寇的力量也已经用尽了，怎么能低头帖耳，任由宦官摆布呢！大唐皇室的子孙还有很多，您为什么不另做打算，为国家谋取利益呢？”萧遘说：“皇上登基已经十多年了，没有犯下什么大的过错。只是因为田令孜在皇上身边独揽大权，才导致皇上连安稳地坐在皇位上都做不到，皇上每次提到这件事，都泪流不止。最近皇上本来没有打算离开京城，是田令孜在宫中陈列军队，逼迫皇上启程，连等到天亮都不肯。所有的罪过都在田令孜身上，这是天下人都知道的！您对皇室尽心尽力，正应该率领军队返回镇所，呈上奏表，迎接皇上的车驾回宫。废立皇帝是国家的大事，即便是伊尹、霍光那样的贤臣，也对此感到为难，我不敢听从您的命令！”朱玫退出后，公开宣称：“我要拥立一位大唐皇室的子孙为皇帝，有谁敢反对，一律斩首！”
夏季，四月壬子日，朱玫逼迫留在凤翔的文武百官拥立嗣襄王李煴暂代军国大事，让他按照皇帝的制度任命百官、指挥调度，还派遣大臣前往蜀地迎接僖宗，在石鼻驿与百官盟誓。朱玫让萧遘撰写册封李煴的册文，萧遘以文思衰退为由推辞，于是朱玫让兵部侍郎、判户部郑昌图来撰写。乙卯日，李煴接受册封，朱玫自己兼任左、右神策十军使，率领文武百官侍奉李煴返回京城长安；任命郑昌图为同平章事，兼判度支、盐铁、户部，还分别设置了副使，将三司的事务全部委托给他。留在河中的文武百官崔安潜等人，向李煴献上表笺，恭贺他接受册封。
田令孜自知不为天下人所容，于是举荐枢密使杨复恭为左神策中尉、观军容使，自己则请求担任西川监军使，前往成都依附陈敬瑄。杨复恭掌权后，排斥田令孜的党羽，将王建贬为利州刺史，晋晖贬为集州刺史，张造贬为万州刺史，李师泰贬为忠州刺史。
五月，朱玫任命中书侍郎、同平章事萧遘为太子太保，自己则加授侍中、诸道盐铁、转运等使；加授裴澈判度支，郑昌图判户部；任命淮南节度使高骈兼中书令，充任江、淮盐铁、转运等使、诸道行营兵马都统；任命淮南右都押牙、和州刺史吕用之为岭南东道节度使。朱玫大行封官赏赐，以此来取悦各地的藩镇。他派遣吏部侍郎夏侯潭前往河北安抚晓谕，派遣户部侍郎杨陟前往江淮安抚晓谕，各地藩镇中有十分之六七的人接受了他的任命，高骈还献上表笺，劝说李煴正式登基称帝。
吕用之建立节度使府署，设置僚属，排场与高骈完全相同；凡是高骈的心腹，以及能够担当重任的将领和官吏，吕用之都逼迫他们顺从自己，他的所有所作所为，都不再向高骈禀报。高骈对他产生了怀疑，暗中想要夺回他的权力，但吕用之的势力已经根深蒂固，高骈对他无可奈何。吕用之察觉到高骈的意图，十分恐惧，便去拜访他的党羽、前度支巡官郑杞和前知庐州事董瑾，郑杞说：“现在再图谋这件事，已经太晚了！”吕用之向他询问对策，郑杞说：“曹孟德曾经说过：‘宁可我辜负别人，不能让别人辜负我。’”第二天，郑杞和董瑾一起写了一封信交给吕用之，信中的内容十分隐秘，没有人知道具体写了什么。
萧遘声称身患疾病，辞官返回永乐县。
起初，凤翔节度使李昌符与朱玫共同谋划拥立李煴为帝，后来朱玫自己担任宰相，独揽大权，李昌符十分愤怒，拒不接受朱玫任命的官职，反而向兴元的僖宗呈上奏表，表明忠心。朝廷下诏加封李昌符为检校司徒。朱玫派遣部将王行瑜率领邠宁、河西的五万士兵，追击僖宗的车驾。感义节度使杨晟率军迎战，屡战屡败，最终放弃散关逃走，王行瑜率军进驻凤州。
当时，各地藩镇的贡品赋税大多运往长安，而不是兴元，跟随僖宗的官员和卫士都缺乏粮食，僖宗愁得泪流满面，不知该如何是好。杜让能对僖宗说：“杨复光和王重荣曾经一起击败黄巢，收复京城，两人关系亲睦友好；杨复恭是杨复光的哥哥。如果派遣一位重臣前往河中，向王重荣阐明大义，并且转达杨复恭的心意，王重荣应该会回心转意，归顺朝廷。”僖宗采纳了他的建议，派遣右谏议大夫刘崇望出使河中，携带诏书晓谕王重荣。王重荣奉命后，派遣使者向朝廷献上十万匹绢帛，并且请求率军讨伐朱玫，以此来赎罪。
戊戌日，李煴派遣使者前往晋阳，赐给李克用诏书，诏书中说：“皇上在前往兴元的途中，禁军发生兵变叛乱，皇上仓促之间驾崩。我被各地藩镇推举拥立，现在已经接受册封，登基为帝。”朱玫也写信给李克用。李克用得知他们的阴谋都是朱玫一手策划的，勃然大怒。大将盖寓劝说李克用道：“皇上流离迁徙，天下人都把罪责归咎于您，现在如果不诛杀朱玫，废黜李煴，您就无法洗刷自己的冤屈。”李克用采纳了他的建议，于是烧毁了李煴的诏书，囚禁了使者，并向邻近的藩镇发布檄文，声称：“朱玫竟敢欺骗各地藩镇，谎称皇上已经驾崩。我已经调发蕃族、汉族士兵三万人，进军讨伐叛逆，希望各藩镇能与我齐心协力，共建大功。”盖寓是蔚州人。
秦贤率军侵扰宋州、汴州，朱全忠在尉氏城南将他击败。癸巳日，朱全忠派遣都将郭言率领步兵、骑兵三万人，攻打蔡州。
六月，朝廷任命扈跸都将杨守亮为金商节度使、京畿制置使，命他率领两万士兵从金州出兵，与王重荣、李克用一起讨伐朱玫。杨守亮本姓訾，名亮，是曹州人，他和弟弟訾信都是杨复光的养子，后来改名为杨守亮、杨守信。
李克用派遣使者向僖宗呈上奏表，声称：“我正调发军队渡过黄河，铲除叛逆党羽，迎接皇上的车驾回宫，希望朝廷下诏，命令各藩镇与我协同作战。”此前，山南地区的百姓都传言李克用与朱玫勾结，人心惶惶；李克用的奏表送到兴元后，僖宗拿出来给跟随的官员们看，并晓谕山南地区的各个藩镇，人心这才安定下来。但李克用的奏表中仍然提及要讨伐朱全忠，僖宗派杨复恭写信晓谕李克用说：“等京城周围地区的局势平定后，再对朱全忠另作处置。”
衡州刺史周岳率军攻打潭州，钦化节度使闵勖招募淮西将领黄皓率军入城，一起坚守潭州，黄皓却趁机杀掉了闵勖。周岳率军攻克潭州城，擒获黄皓，将他斩杀。
镇海节度使周宝派遣牙将丁从实率军袭击常州，驱逐了张郁。张郁逃往海陵，依附镇遏使、南昌人高霸。高霸原本是高骈的部将，镇守海陵，拥有百姓五万户，士兵三万人。
秋季，七月，秦宗权率军攻陷许州，杀死许州节度使鹿晏弘。
王行瑜率军进攻兴州，感义节度使杨晟放弃镇所逃走，率军占据文州。朝廷下诏命令保銮都将李鋋、扈跸都将李茂贞、陈佩率军驻守大唐峰，抵御王行瑜。李茂贞是博野人，本姓宋，名文通，因立下战功，被皇帝赐姓名为李茂贞。
朝廷下令将钦化军改名为武安军，任命衡州刺史周岳为武安节度使。
八月，卢龙节度使李全忠去世，朝廷任命他的儿子李匡威为卢龙留后。
王潮率军攻克泉州，杀死刺史廖彦若。王潮听说福建观察使陈岩威名远扬，因此不敢进犯福州地界，于是派遣使者向陈岩投降，陈岩便上表朝廷，举荐王潮为泉州刺史。王潮沉稳勇敢，富有智谋和韬略，占据泉州后，招抚流亡失散的百姓，平均赋税，修缮兵器，官吏和百姓都对他心悦诚服。王潮把王绪幽禁在一所偏房里，王绪感到羞愧，最终自杀身亡。
九月，朱玫的部将张行实率军攻打大唐峰，李鋋等人率军将他击退。金吾将军满存率军与邠宁的军队交战，击败敌军，重新夺回兴州，率军进驻万仞寨坚守。
李克修率军攻打孟方立，甲午日，在焦冈擒获孟方立的部将吕臻，攻克故镇、武安、临洺、邯郸、沙河等地，任命大将安金俊为邢州刺史。
留在长安的文武百官、太子太师裴璩等人，劝说李煴正式登基称帝。冬季，十月，李煴登基称帝，改年号为建贞，遥尊僖宗为太上元皇帝。
董昌对钱镠说：“你如果能攻取越州，我就把杭州交给你。”钱镠说：“好的，如果不攻取越州，终究会成为后患。”于是钱镠率领军队从诸暨出发，直奔平水，开山辟路五百里，从曹娥埭出兵。浙东将领鲍君福率领部众向钱镠投降。钱镠率军与浙东的军队交战，屡次击败敌军，率军进驻丰山。
感化军牙将张雄、冯弘铎得罪了节度使时溥，于是集结了三百名士兵，渡过长江，袭击苏州，将其攻占。张雄自封为苏州刺史，逐渐集结士兵五万人，战舰一千多艘，自号天成军。
河阳节度使诸葛爽去世，大将刘经、张全义拥立诸葛爽的儿子诸葛仲方为河阳留后。张全义是临濮人。
李克修率军攻打邢州，未能攻克，只好率军返回。
十一月丙戌日，钱镠攻克越州，刘汉宏逃往台州。
义成节度使安师儒把政事全部委托给两厢都虞候夏侯晏、杜标，这两个人骄横放肆，军中将士都对他们心怀怨恨。小校张骁偷偷出城，聚集两千人攻打州城，安师儒斩杀夏侯晏、杜标，将二人的首级示众，军中的动荡才稍稍平息。天平节度使朱瑄图谋夺取滑州，派遣濮州刺史朱裕率军引诱张骁，将他杀死。朱全忠先派部将朱珍、李唐宾袭击滑州，军队进入滑州境内时，遭遇大雪。朱珍等人连夜疾驰到滑州城下，架起上百架云梯同时攻城，最终攻克滑州，生擒安师儒，并将他带回汴州。朱全忠任命牙将、江陵人胡真知担任义成留后。
田令孜抵达成都后，请求准许自己寻访医生治病，朝廷批准了他的请求。
十二月戊寅日，各路军队攻克凤州，朝廷任命满存为凤州防御使。
杨复恭向关中地区发布檄文，宣称“能斩获朱玫首级的人，就任命他为静难节度使”。王行瑜接连战败，担心被朱玫治罪，便和部下商议说：“如今我们没有功劳，回去也是死路一条；不如和你们一起斩杀朱玫，平定京城的动乱，迎接皇上的车驾回宫，求取邠宁节度使的符节斧钺。”部众都表示赞同。甲寅日，王行瑜擅自率领军队从凤州返回京城，朱玫正在处理政务，听到消息后大怒，急忙召见王行瑜，斥责他说：“你擅自率军返回，是想谋反吗？”王行瑜说：“我不是谋反，是要诛杀谋反的贼臣朱玫！”于是将朱玫擒获斩杀，还诛杀了他的党羽数百人。各路军队陷入大乱，在京城内烧杀掳掠，百姓们没有衣服御寒，冻死者的尸体遍布地面。裴澈、郑昌图率领文武百官二百多人侍奉襄王李煴逃往河中，王重荣假意出城迎接，趁机擒获李煴，将他杀死，又囚禁了裴澈、郑昌图；随行的百官死亡人数将近一半。
台州刺史杜雄引诱刘汉宏，将他擒获后押送给董昌，董昌下令将刘汉宏斩首。董昌把镇所迁移到越州，自称掌管浙东军府事务，任命钱镠掌管杭州事务。
王重荣将李煴的首级装在匣子里，送往僖宗的驻地。刑部请求僖宗亲临兴元城南门举行献俘仪式，文武百官一起入朝庆贺。太常博士殷盈孙上奏提出建议，认为：“李煴是被叛贼胁迫拥立的，他的罪过只是没能以死坚守臣节罢了。按照礼制，皇室宗亲如果犯下死罪，君主应当为他身穿素服，停止奏乐。如今李煴已经被诛杀，应该将他废为平民，命令当地官府埋葬他的首级。至于献俘庆贺的礼仪，请等朱玫的首级送到后再举行。”僖宗采纳了他的建议。殷盈孙是殷侑的孙子。
河阳大将刘经忌惮李罕之难以控制，便亲自率军镇守洛阳，又率军前往渑池袭击李罕之，反被李罕之击败。刘经放弃洛阳逃走，李罕之率军追击，几乎将刘经的军队斩杀殆尽。李罕之率军驻守巩县，准备渡过黄河，刘经派遣张全义率军抵御他。当时诸葛仲方年幼势弱，政事都由刘经把持，将领们大多不肯归附他。张全义于是和李罕之联合率军攻打河阳，结果被刘经击败，李罕之、张全义逃走，退保怀州。
起初，忠武决胜指挥使孙儒与龙骧指挥使、朗山人刘建锋一同驻守蔡州，抵御黄巢，扶沟人马殷隶属军中，凭借自身的才能和勇猛闻名。等到秦宗权叛乱，孙儒等人都归附了他。秦宗权派遣孙儒率军攻陷郑州，郑州刺史李璠逃往大梁。孙儒又进军攻陷河阳，河阳留后诸葛仲方也逃往大梁。孙儒自称节度使，张全义占据怀州，李罕之占据泽州，以此抵御孙儒。起初，长安人张佶担任宣州幕僚，因厌恶观察使秦彦的为人，于是辞官离去，路过蔡州时，被秦宗权留下，任命为行军司马。张佶对刘建锋说：“秦宗权刚愎凶狠又生性猜忌，他离败亡之日不远了，我们这些人要怎样才能保全自己呢！”刘建锋也正为自己的处境感到担忧，于是和张佶交好。
寿州刺史张翱派遣部将魏虔率领一万人侵扰庐州，庐州刺史杨行愍派遣部将田頵、李神福、张训率军抵御，在褚城击败魏虔。滁州刺史许勍率军袭击舒州，舒州刺史陶雅逃往庐州。高骈下令让杨行愍改名为杨行密。
这一年，天平牙将朱瑾驱逐泰宁节度使齐克让，自称泰宁留后。朱瑾准备袭击兖州时，先向齐克让求婚，然后从郓州出发，置办了华丽的车马服饰，暗中藏好兵器铠甲前去兖州。在迎亲的当晚，朱瑾的士兵突然发动袭击，驱逐齐克让，取而代之。朝廷于是任命朱瑾为泰宁节度使。
安陆贼寇首领周通率军攻打鄂州，鄂州刺史路审中弃城逃走。岳州刺史杜洪趁机率军进入鄂州，自称武昌留后，朝廷于是正式任命他担任这一职务。湘阴贼寇首领邓进思又趁机率军攻陷岳州。
秦宗言率军围攻荆南长达两年，张瑰环城坚守。城中一斗米的价格涨到四十缗，连铠甲和战鼓都被吃光了，士兵们只能敲击门板来报更警戒，城中饿死的人尸体相互枕藉。秦宗言最终还是没能攻克荆南，只好率军离去。