朱元璋非常高兴，当即下令，只带数人乘马车出发，奔赴胡惟庸府上。
当朱元璋走到西华门时，一个叫做云奇的太监拦住了马车。
侍卫怒斥云奇，但云奇已经急的说不出话来。
于是侍卫就丈击云奇，朱元璋见云奇有些蹊跷，下车查看。
此时，被打的奄奄一息的云奇，伸手指向胡惟庸的府邸方向。
朱元璋不明所以，登上宫城查看，只见胡惟庸家中尘土飞扬，墙道中埋伏兵甲。
于是朱元璋动怒，派出重兵抓捕胡惟庸，发动了胡惟庸案。
此案持续十余年，一直从胡惟庸到李善长全家被处死，杀了三万余人。
借此机会，朱元璋废除了几千年的丞相制度。
其二：蓝玉案。
自朱彪死后，朱元璋大力培养皇太孙朱允炆。
大概是怕朱允炆不能驾驭开国武将，朱元璋在洪武二十六年发动了蓝玉案。
锦衣卫告发蓝玉造反，朱元璋下令将蓝玉抓捕，迅速处决，剥皮实草，传示各地。
随后朱元璋大肆诛连，景川侯曹震、鹤庆侯张翼等一众高级将领被定为“蓝党”诛杀。
据朱元璋在《逆臣录》诏书中自称，“族诛者万五千人”。
通过此案，明初的功勋武将几乎被屠戮殆尽，为皇太孙登基之路铺平。
然而，大多数人认为，蓝玉案，被朱元璋处死的应该超过两万人。
其三：空印案。
洪武年间，各地州府，每年年底需要到南京城，和户部核对一年的账目。
但由于路途遥远，且当年必须要核对完。
户部与各地，必定会有些出入。
可一旦各州府的人，到了京城后，发现账目与户部对不上，就得重新回州府核对完，再回来与户部重新核对。
就这样，一但有对不上的，那就是犯了大罪，所有州府官员都会被牵连。
因此，各州府官员，承袭古时的旧制度，带一本盖完州府大印的空账册来京。
一但与户部对不上，和户部商议之后，重新在盖完大印的账册上写上一本。
这样，账目也能对应上，也不用来回折腾了。
然而锦衣卫发现后告诉朱元璋，他动怒了。
朱元璋认为这是官员相互勾结、欺君舞弊的典型，下令严惩。
他下令将各地方衙门的主印官（如知府、知县）一律处死，副职及以下官员杖一百并发配边疆。
方孝孺的父亲、大明第一清官济宁知府方克勤便因此案被杀。
此案官方记载被杀者数百，流放戍边者数千。
其实民间记载，被杀者过万，流放者数不胜数。
其四：郭桓案。
户部侍郎郭桓等人勾结北平承宣布政使司李彧等人，利用职权盗卖官粮，并巧立名目，私征多种赋税，中饱私囊。
朱元璋下令调查，经三法司调查，此事儿是真的。