处理完前明遗民问题，一个新的、关乎国本的大事提上日程：定都。
此时的“大陈”政权，名义上以北京为中枢，但陈远本人尚未正式登基，朝廷机构也分散各地——六部在北京，水师基地在登州，讲武堂在大同，钱粮中心在太原。
这种临时状态必须结束。
这一日，陈远召集文武重臣、各地督抚，甚至邀请了朱聿鐭等前明宗室代表，在紫禁城建极殿召开“定都会议”。会议尚未开始，殿外已分成数派，争论不休。
以赵胜为首的北伐系将领力主定都北京：
“殿下！北京虎踞幽燕，北控大漠，南扼中原，实为形胜之地！且经过数年经营，城防完备，宫室现成。若迁都他处，恐北方空虚，蒙古、女真再起！”
但以柳如是、钱谦益为代表的江南文臣则主张还都南京：
“金陵龙蟠虎踞，王气所钟！自东吴以降，六朝古都，天下文枢。且江南财赋，甲于天下。定都南京，可依托长江天险，坐拥东南财富。”
新任四川巡抚杨展（原大西军将领，归顺后屡立战功）提出第三种意见：“何不定都长安？关中四塞之地，昔秦汉隋唐皆以此为基，成就帝业！且西安城郭完固，可攻可守。”
还有提议洛阳的、开封的，甚至有人提议“效仿大明，设南北两京”。
会议正式开始，陈远端坐御座，让各方畅所欲言。
赵胜第一个发言，他指着殿中巨大的沙盘：“诸位请看！北京背靠燕山，面临平原，辽东、宣大、蓟镇三关拱卫，实为天下脊梁。昔年永乐皇帝迁都于此，正是为‘天子守国门’。今漠南蒙古新附，辽东女真未平，若弃北京，则长城防线危矣！”
钱谦益颤巍巍起身：“赵将军所言，乃军事之见。然治国非只凭刀兵。江南膏腴之地，岁供天下泰半钱粮。自唐以来，天下财赋，仰给东南。且南京宫室完备，省营造之费；水运便利，免漕运之劳。此经济之道也。”
柳如是补充道：“还有人心。江南士民，久沐王化。定都南京，可迅速收拢东南人心。且南京距闽、粤、湖广皆近，便于控制南方未靖之地。”
杨展性格直率，大声道：“长安有何不好？当年高祖以此定天下，太宗以此开盛世！关中虽不及江南富庶，然山河险固，民风彪悍。据之可俯瞰中原，鞭挞天下！”
众人各执一词，争论从清晨持续到午后。
陈远始终沉默倾听，直到一位意想不到的人开口。
是朱聿鐭。
这位隆武帝的弟弟，因书画造诣被聘为翰林院待诏，今日破例参会。
他起身向陈远一揖：“罪臣本不当言，然事关国本，斗胆进言。”
“但说无妨。”
“谢殿下。”
朱聿鐭清了清嗓子，“诸位所言，各有道理。北京得形势，南京得财赋，长安得险固。然...”
他话锋一转，“诸位置百姓于何地？”
殿内一静。
“罪臣修《明史》，读至崇祯朝，常掩卷长叹。
崇祯二年，为筹辽饷，加征‘三饷’，天下骚然。其时朝廷在北，而赋税重地在南。
漕运四千里，损耗过半，民夫死者相枕于道。
此乃都北而仰食于南之弊也。”
他走到沙盘前，手指从南京划向北京：“漕粮北运，一石至京，费银数两。
运河年年修，黄河岁岁决。