“白银滚滚来”为帝国注入了强大的资本血液，而“技术可交流”则提供了新的知识工具。两者的结合，在市场需求（尤其是海外市场对标准化、大批量商品的需求）和政策鼓励（《专利鼓励法》、对“奇技巧思”的奖掖）的催化下，开始在传统手工业的深厚土壤中，催生出带有近代意义的工业萌芽。
这些萌芽散落在东南沿海和部分内陆资源产区，规模不大，技术也多是手工改良与简单机械的结合，远未达到“工业革命”的程度，但其展现的新组织方式、生产关系和生产力指向，已悄然改变着经济生态。
萌芽之一，是 纺织业 的集中化与分工深化。
受欧洲对中国棉布（“南京布”）、丝绸需求旺盛的刺激，以及国内市场的扩大，在松江（上海）、苏州、广州、佛山等传统纺织中心，生产组织形式开始发生变化。
“账房”制流行：一些资金雄厚的布商、绸缎庄不再仅仅从分散的个体机户手中收购成品，而是开始设立“账房”，将纺纱、织布、染色、踹光等不同工序，发包给城郊或乡村的专业作坊或家庭手工业者，并提供统一的原料（棉纱、生丝）、规格要求，甚至预付部分工本。
账房负责质量控制、统一销售。
这实际是资本主义包买商（分散的手工工场）的形态，加强了商人资本对生产过程的控制，促进了分工专业化。
工具改良：在苏松地区，出现了改进的多锭纺车（可同时纺多根纱），提高了纺纱效率。
织机方面，除了传统的提花机，从西洋引入的飞梭被工匠尝试模仿，虽然未能普及，但显示了提高织布速度的努力。
广州的丝绸业，为迎合欧洲市场对轻薄、光亮绸缎的喜好，在练染、压光工艺上精益求精，并出现了专门为外销设计花样的“洋庄”。
雇佣劳动出现：在苏州、杭州的较大丝织工坊和佛山的棉布染踹作坊中，开始出现脱离土地、完全依靠工资为生的雇佣工人，他们受雇于“账房”或大作坊主，按件或按日计酬，形成了初期的劳动力市场。
萌芽之二，是 陶瓷业 的规模化与技术创新。
景德镇 依然是帝国的瓷都，海外订单（尤其是欧洲皇室、贵族对“克拉克瓷”、“伊万里风格”瓷器的狂热追求）使其生产持续扩张。
官民窑并举，民窑壮大：御窑厂（官窑）在承担宫廷用瓷和赏赉外藩任务的同时，其先进技术和管理经验也外溢到民窑。
大量民窑 蓬勃发展，形成了“官搭民烧”（官窑将部分订单委托民窑完成）和民窑自主经营并存的局面。
民窑为适应外销需求，生产灵活，注重成本，规模不断扩大，出现了雇工数十甚至上百的较大窑场。
分工极致细化：景德镇制瓷流程的分工达到令人惊叹的细致程度，从采石制泥、拉坯利坯、画坯吹釉、满窑烧窑到开窑选瓷，每一道工序都有专门的工匠，形成了高度专业化的生产链条，效率和质量控制得以提升。
技术吸收与创新：通过广州口岸和耶稣会士，景德镇工匠接触到西洋的珐琅彩 技术和玻璃制作工艺，尝试将其融入瓷器装饰，创烧出粉彩、洋彩 等新品种，备受海外市场欢迎。同时，在窑炉结构（尝试改进以获得更稳定高温）、釉料配方（追求更鲜艳、稳定的色彩）方面也在不断摸索。
萌芽之三，是 矿冶与金属加工业 的初步发展。
为满足铸币、军器制造、造船、工具生产的需要，以及海外对铜、铁、锌的需求，在云南、广东、湖南、四川等矿产资源地，矿业和冶炼业有所发展。