“内阁负责制”的推行，如同为帝国政治机器更换了更精密的传动齿轮，但要使其高效运转，驱动齿轮的“动力源”——官员的素质与能力——必须同步升级。
旧的科举制度，以八股文为核心，禁锢思想，脱离实际，选拔出的多是皓首穷经、熟稔程朱语录却不通世务的“冬烘先生”，显然难以适应“启明”时代对内政、外交、经济、军事、技术等多方面人才的迫切需求。
改革科举，早已是陈远、徐光启等有识之士的共识，在“新政”推行多年、新体制初建的背景下，终于到了动大手术的时机。
启明二十四年春，在首席大学士徐光启的主持下，内阁会同礼部、国子监，并征询了格致院、贵族议院 中开明议员的意见，拟定了详尽的《改革科举，振兴实学疏》，呈报皇帝。
陈远御批：“科举取士，关系重大。
八股空文，误国已久。当因时变革，务求实用。
着内阁、礼部详议章程，奏明施行。”
改革大幕就此拉开。
改革的核心，便是废除八股文。
诏书明令：“自启明二十五年乡试始， 天下科举， 永停八股文体。
所试经义，但取其明理达意，不以格套 拘泥，不以浮华相尚。
主考官当以实学真才为取，勿蹈空疏积 习。”
废除八股仅是第一步，更重要的是考试内容与科目的全面革新。
新的科举制度，仿照明代“三场”旧制框架，但内容焕然一新：
第一场，考“经义”与“策论”。
“经义”不再要求死记硬背朱注，而是考察对《四书五经》义理的理解与阐发，鼓励结合时事、有独立见解。
“策论”成为重中之重，要求考生就时政、经济、军事、水利、边防、教化等现实问题，撰写论述文章，考察其分析问题、解决问题的实际能力。
题目多从当前国家面临的真实挑战中选取，如“论漕运与海运利弊”、“如何安抚新附之漠南蒙古诸部”、“振兴工商以富国论”、“防遏海外西人之策”等。
第二场，考“判牍”与“律法”。
“判牍”模拟官府判案，给出案例，要求考生依据《大陈律》写出判词，考察其法律知识和实务能力。
“律法”则考察对《大陈律》核心条款和立法精神的理解。
第三场，考“算学”与“格致”。
这是最具颠覆性的改革。
“算学”考察算术、几何、代数基础，题目涉及土地测量、粮谷计算、工程预算等实用数学。
“格致”则包括天文、地理、农学、水利、机械 等基础常识，如“论节气与农时”、“简述黄河水患成因”、“火铳胜于弓弩之理”等。
试题由格致院专家参与拟定，确保科学性和实用性。